RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 RAP2BP61225 183 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM230Q96A57 120 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 MUCL1Q96DR8 90 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 FAHD2AQ96GK7 314 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 HSPB11Q9Y547 144 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 HSPB6O14558 160 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 PI3P19957 117 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 GCH1P30793 250 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 TAS2R31P59538 309 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 Q6ZR03 302 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 MRGPRGQ86SM5 289 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 LINC00596Q86U02 117 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF286AQ9HBT8 521 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 CDIPTO14735 213 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 GRPP07492 148 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 IL13RA1P78552 427 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 IL13RA2Q14627 380 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 C3orf36Q3SXR2 165 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 C22orf34Q6ZV56 151 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM185AQ8NFB2 350 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 LIME1Q9H400 295 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 NECAP2Q9NVZ3 263 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 IGF2RP11717 2491 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM210A6NLX4 147 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 F5H5P2 479 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 OR5H8P0DN80 308 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 VAMP1P23763 118 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 ERVK11-1P61568 191 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 DHODHQ02127 395 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 MSMPQ1L6U9 139 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 LY6G6FQ5SQ64 297 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 LIN54Q6MZP7 749 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 C11orf88Q6PI97 169 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 C1orf174Q8IYL3 243 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 SUMF2Q8NBJ7 301 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 SCGB3A2Q96PL1 93 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 RHOFQ9HBH0 211 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 TUBD1Q9UJT1 453 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP5-204ENST00000412806 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 RGS13O14921 159 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 CCKARP32238 428 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 MPPED2Q15777 294 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 CASTOR1Q8WTX7 329 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 MITD1Q8WV92 249 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 OPN4Q9UHM6 478 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 MCRIP1C9JLW8 97 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF205O95201 554 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 GSTT2P0CG29 244 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 PGA5P0DJD9 388 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 GLRA1P23415 457 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM128Q5BJH2 165 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 NEK7Q8TDX7 302 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 WDR13Q9H1Z4 485 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 CXXC4Q9H2H0 198 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 MSL2Q9HCI7 577 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 TRAV24A0A0B4J272 114 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 HS3ST1O14792 307 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 NAPSAO96009 420 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 Q6P435 159 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 NRIP2Q9BQI9 281 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 CRYAAP02489 173 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 C1QTNF9P0C862 333 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 PGAM2P15259 253 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 GMFBP60983 142 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 RBPJQ06330 500 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 DHRS11Q6UWP2 260 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 C11orf53Q8IXP5 236 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 Q8IYB0 196 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 RDH5Q92781 318 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 SLA2Q9H6Q3 261 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 SPACA1Q9HBV2 294 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 Q9N2K0 584 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 CCSO14618 274 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 PPP3CBP16298 524 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 C5orf24Q7Z6I8 188 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 LRP11Q86VZ4 500 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 OR5M8Q8NGP6 311 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 PHB2Q99623 299 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 IFT22Q9H7X7 185 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC23A1Q9UHI7 598 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-204ENST00000412806 CADP27708 2225 aa18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms