RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 C17orf107Q6ZR85 190 aa24.89■■□□□ 1.58
PKDCC-202ENST00000401498 OSR2Q8N2R0 312 aa24.89■■□□□ 1.58
PKDCC-202ENST00000401498 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PKDCC-202ENST00000401498 YIPF6Q96EC8 236 aa24.89■■□□□ 1.58
PKDCC-202ENST00000401498 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa24.89■■□□□ 1.58
PKDCC-202ENST00000401498 DCTN5Q9BTE1 182 aa24.89■■□□□ 1.58
PKDCC-202ENST00000401498 SHARPINQ9H0F6 387 aa24.89■■□□□ 1.58
PKDCC-202ENST00000401498 FAM234AQ9H0X4 552 aa24.89■■□□□ 1.58
PKDCC-202ENST00000401498 OR2H2O95918 312 aa24.88■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 J3QLI3 93 aa24.88■■□□□ 1.57
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PKDCC-202ENST00000401498 MYL9P24844 172 aa24.88■■□□□ 1.57
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PKDCC-202ENST00000401498 LY6G5BQ8NDX9 201 aa24.87■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 RNF167Q9H6Y7 350 aa24.87■■□□□ 1.57
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PKDCC-202ENST00000401498 SLC25A28Q96A46 364 aa24.86■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 GHRLQ9UBU3 117 aa24.86■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 OPN4Q9UHM6 478 aa24.86■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa24.85■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 SLC17A2O00624 439 aa24.85■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF44P15621 663 aa24.85■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 GABRR1P24046 479 aa24.85■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 OR10A3P58181 314 aa24.85■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 OR8H2Q8N162 312 aa24.85■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 CENPOQ9BU64 300 aa24.85■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 CHST6Q9GZX3 395 aa24.85■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 PLGRKTQ9HBL7 147 aa24.85■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF581Q9P0T4 197 aa24.85■■□□□ 1.57
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PKDCC-202ENST00000401498 BANF2Q9H503 90 aa24.84■■□□□ 1.57
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PKDCC-202ENST00000401498 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 LIPFP07098 398 aa24.84■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 UBBP0CG47 229 aa24.84■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 PPIAL4GP0DN37 164 aa24.84■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 RAB3BP20337 219 aa24.84■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 CHST4Q8NCG5 386 aa24.84■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 KCTD7Q96MP8 289 aa24.84■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 AUP1Q9Y679 476 aa24.84■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 DSCAML1Q8TD84 2053 aa24.84■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 MXRA5Q9NR99 2828 aa24.83■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 VSIG8P0DPA2 414 aa24.83■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 OR3A1P47881 315 aa24.83■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 OR4M1Q8NGD0 313 aa24.83■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 OR5D13Q8NGL4 314 aa24.83■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 MRI1Q9BV20 369 aa24.83■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 FUNDC2Q9BWH2 189 aa24.83■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 KCNK15Q9H427 330 aa24.83■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 C19orf12Q9NSK7 152 aa24.83■■□□□ 1.57
PKDCC-202ENST00000401498 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
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PKDCC-202ENST00000401498 P2RY14Q15391 338 aa24.82■■□□□ 1.56
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PKDCC-202ENST00000401498 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa24.82■■□□□ 1.56
PKDCC-202ENST00000401498 OR10K2Q6IF99 312 aa24.82■■□□□ 1.56
PKDCC-202ENST00000401498 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PKDCC-202ENST00000401498 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa24.82■■□□□ 1.56
PKDCC-202ENST00000401498 FAM46BQ96A09 425 aa24.82■■□□□ 1.56
PKDCC-202ENST00000401498 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa24.82■■□□□ 1.56
PKDCC-202ENST00000401498 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa24.81■■□□□ 1.56
PKDCC-202ENST00000401498 TRAV24A0A0B4J272 114 aa24.81■■□□□ 1.56
PKDCC-202ENST00000401498 CRLF1O75462 422 aa24.81■■□□□ 1.56
PKDCC-202ENST00000401498 CLDN12P56749 244 aa24.81■■□□□ 1.56
PKDCC-202ENST00000401498 QRFPP83859 136 aa24.81■■□□□ 1.56
PKDCC-202ENST00000401498 TAF9Q16594 264 aa24.81■■□□□ 1.56
PKDCC-202ENST00000401498 GDPD3Q7L5L3 318 aa24.81■■□□□ 1.56
PKDCC-202ENST00000401498 DMRTB1Q96MA1 342 aa24.81■■□□□ 1.56
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