RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399336.8

NOMO3-202, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 4,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-202ENST00000399336 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 G6PC2Q9NQR9 355 aa16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 RASL12Q9NYN1 266 aa16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF391Q9UJN7 358 aa16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 PKDREJQ9NTG1 2253 aa16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 PLXNA3P51805 1871 aa16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 BTCP35070 178 aa16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 HTD2P86397 168 aa16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 NCMAPQ5T1S8 102 aa16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 OR2C3Q8N628 320 aa16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 OR10D4PQ8NGN7 298 aa16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 PTX4Q96A99 478 aa16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 SHARPINQ9H0F6 387 aa16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 G0S2P27469 103 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 CALCRP30988 508 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 TMEM68Q96MH6 324 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 RAB9BQ9NP90 201 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 BDP1A6H8Y1 2624 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 TRPM7Q96QT4 1865 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF727A8MUV8 499 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 PSMB3P49720 205 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 ZXDAP98168 799 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 ALKBH6Q3KRA9 238 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 FAM185AQ8N0U4 392 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 FAM58AQ8N1B3 248 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF610Q8N9Z0 462 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 APCDD1LQ8NCL9 501 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 M1APQ8TC57 530 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 ZPBPQ9BS86 351 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 NMES1Q9C002 83 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 SLC2A9Q9NRM0 540 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 UQCC1Q9NVA1 299 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 TERTO14746 1132 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 PLGLAQ15195 96 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 TMEM41BQ5BJD5 291 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 DYNLRB1Q9NP97 96 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 MED9Q9NWA0 146 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 J3QRE1 110 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 LYZL6O75951 148 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 DMWDQ09019 674 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 OR6S1Q8NH40 331 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 IP6K3Q96PC2 410 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 NPAS1Q99742 590 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 OPA3Q9H6K4 179 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 FAM206AQ9NX38 181 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 FZR1Q9UM11 496 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 AMDHD2Q9Y303 409 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 CLEC18AA5D8T8 446 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 C2orf68Q2NKX9 166 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 CLEC18CQ8NCF0 446 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 CLDN23Q96B33 292 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 SOX7Q9BT81 388 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 NOTCH4Q99466 2003 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 SHISA7A6NL88 538 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 ISG15P05161 165 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 MAGEA5P43359 124 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 MEOX1P50221 254 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF787Q6DD87 383 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 C17orf78Q8N4C9 275 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 HIPK2Q9H2X6 1198 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 MT-CO3P00414 261 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 RAB39BQ96DA2 213 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 TECTBQ96PL2 329 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 KLHDC3Q9BQ90 382 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 TMEM38BQ9NVV0 291 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 MIOXQ9UGB7 285 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 A0A1W2PR64 198 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 A0A1W2PRV1 198 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 LRP5LA4QPB2 252 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 C17orf112F2Z3M2 114 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 ZBTB25P24278 435 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 DHODHQ02127 395 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 TEX30Q5JUR7 227 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 HOGA1Q86XE5 327 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 SPSB2Q99619 263 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 THSD7BQ9C0I4 1608 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 GPR37O15354 613 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 OR2H1Q9GZK4 316 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 TOLLIPQ9H0E2 274 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 OR5AC2Q9NZP5 309 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 GDF9O60383 454 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 OR10P1Q8NGE3 313 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NOMO3-202ENST00000399336 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms