RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362776.1

RNU6-1272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1272P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BTRCQ9Y297 605 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ORC6Q9Y5N6 252 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1272P-201ENST00000362776 USH1CQ9Y6N9 552 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CACNG3O60359 315 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GYPCP04921 128 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RAP1GDS1P52306 607 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF117Q03924 483 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SKP2Q13309 424 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 UBE2NLQ5JXB2 153 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCNYL1Q8N7R7 359 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OR2M3Q8NG83 312 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GLT1D1Q96MS3 346 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TAPBPLQ9BX59 468 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PECRQ9BY49 303 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ANKRA2Q9H9E1 313 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MCUBQ9NWR8 336 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SAR1BQ9Y6B6 198 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 COL7A1Q02388 2944 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HEATR9A2RTY3 570 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 A8MWP6 167 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CXCL11O14625 94 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PLA2G10O15496 165 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HLA-HP01893 362 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SCGB1C2P0DMR2 95 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GFAPP14136 432 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SPAM1P38567 509 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RELAQ04206 551 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 APOFQ13790 326 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZMYND11Q15326 602 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OR8G1Q15617 311 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GABRA6Q16445 453 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NNATQ16517 81 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CDNFQ49AH0 187 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TTC32Q5I0X7 151 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MARCH3Q86UD3 253 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SBSPONQ8IVN8 264 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DAW1Q8N136 415 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FAM19A2Q8N3H0 131 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SCGB1C1Q8TD33 95 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C20orf24Q9BUV8 137 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KCNIP2Q9NS61 270 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DHRS12A0PJE2 317 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZW10O43264 779 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RNF13O43567 381 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MPDU1O75352 247 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FTH1P02794 183 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CATP04040 527 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CRYGDP07320 174 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SOD3P08294 240 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KRT16P08779 473 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ATF1P18846 271 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LPAR6P43657 344 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CDK5R1Q15078 307 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PSG3Q16557 428 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZCWPW2Q504Y3 356 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ERICH5Q6P6B1 374 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 AGTRAPQ6RW13 159 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCDC121Q6ZUS5 278 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 VTCN1Q7Z7D3 282 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OR10Z1Q8NGY1 313 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OR52E5Q8NH55 327 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C8orf44Q96CB5 159 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CPB2Q96IY4 423 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC35G5Q96KT7 338 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MBOAT7Q96N66 472 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ANAPC13Q9BS18 74 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TMED9Q9BVK6 235 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PLEKHA1Q9HB21 404 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MED9Q9NWA0 146 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 STK38LQ9Y2H1 464 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC5A10A0PJK1 596 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CD300LBA8K4G0 201 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BCKDKO14874 412 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SOX14O95416 240 aa-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms