RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 HES4Q9HCC6 221 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 GLS2Q9UI32 602 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC42Q9Y546 428 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TGP01266 2768 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PPH5 198 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PRD5 423 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PRF3 423 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PRM7 423 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 MEIOCA2RUB1 952 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 E9PI62 339 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 EREGO14944 169 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TNFAIP8O95379 198 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PAHP00439 452 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 KNG1P01042 644 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CRYBA1P05813 215 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 HCKP08631 526 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ATF1P18846 271 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SAA4P35542 130 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 IER3P46695 156 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2E1P51965 193 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 RAG2P55895 527 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ERVK11-1P61568 191 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 IRF3Q14653 427 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CDH26Q8IXH8 852 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PNKDQ8N490 385 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 DYRK2Q92630 601 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF14Q92956 283 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 CEP19Q96LK0 163 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 SLITRK2Q9H156 845 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 C1RLQ9NZP8 487 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.27□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 MEGF11A6BM72 1044 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 BTBD17A6NE02 478 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 F8VVB4 439 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 F8VWA3 439 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 H3BUI4 141 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ANGPTL7O43827 346 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 GPR137BO60478 399 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 GPX5O75715 221 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ARL6IP5O75915 188 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 INMTO95050 263 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFA7O95182 113 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TK1P04183 234 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ALDOBP05062 364 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 HSMCR30P0CW71 290 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 FSTP19883 344 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 POU3F4P49335 361 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 COL10A1Q03692 680 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 TPBGQ13641 420 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 DOC2BQ14184 412 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF773Q6PK81 442 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 OR4F5Q8NH21 305 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 GPER1Q99527 375 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 S100A13Q99584 98 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 BEX1Q9HBH7 125 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.26□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WXM4 84 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GUS0 222 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PPE2 198 aa6.25□□□□□ -1.41
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PR64 198 aa6.25□□□□□ -1.41
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