RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 FAM169BQ8N8A8 192 aa15.23■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 SCGB3A2Q96PL1 93 aa15.23■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 GON7Q9BXV9 100 aa15.23■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 TMEM100Q9NV29 134 aa15.23■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 NECAP2Q9NVZ3 263 aa15.23■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 CCSO14618 274 aa15.22■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 GRPP07492 148 aa15.22■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 PGAM2P15259 253 aa15.22■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 BMP5P22003 454 aa15.22■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 TIMM23BQ5SRD1 257 aa15.22■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa15.22■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 OR8G5Q8NG78 346 aa15.22■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 SLX1AQ9BQ83 275 aa15.22■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 BCL2L14Q9BZR8 327 aa15.22■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 ZNF286AQ9HBT8 521 aa15.22■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 ASF1BQ9NVP2 202 aa15.22■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa15.22■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa15.22■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 A0A0G2JNJ9 132 aa15.21■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 M0R1B8 84 aa15.21■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 CDIPTO14735 213 aa15.21■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 MLNRO43193 412 aa15.21■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 SSTR2P30874 369 aa15.21■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 NAAAQ02083 359 aa15.21■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 FAM27E3Q08E93 113 aa15.21■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 ZNF154Q13106 437 aa15.21■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 TMEM128Q5BJH2 165 aa15.21■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 KCTD9Q7L273 389 aa15.21■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 C5orf24Q7Z6I8 188 aa15.21■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 PHB2Q99623 299 aa15.21■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 PLK3Q9H4B4 646 aa15.21■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 Q9UFV3 132 aa15.21■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 HS3ST1O14792 307 aa15.21■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 GMFBP60983 142 aa15.21■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 SLC9A3R2Q15599 337 aa15.21■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 ZNF718Q3SXZ3 478 aa15.21■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 DHRS11Q6UWP2 260 aa15.21■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZR03 302 aa15.21■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 SUMF2Q8NBJ7 301 aa15.21■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 OR5M8Q8NGP6 311 aa15.21■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 PRR13Q9NZ81 148 aa15.21■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 SLC23A1Q9UHI7 598 aa15.21■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 PLSCR5A0PG75 271 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 A8MXE2 369 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 MCRIP1C9JLW8 97 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 SFT2D2O95562 160 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 PPP3CBP16298 524 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 KITLGP21583 273 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 TUBG1P23258 451 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 CLEC18BQ6UXF7 455 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 NEK7Q8TDX7 302 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 WDR13Q9H1Z4 485 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 TUBG2Q9NRH3 451 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 TRAV24A0A0B4J272 114 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 GCH1P30793 250 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 IL13RA2Q14627 380 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 C22orf34Q6ZV56 151 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 LINC00596Q86U02 117 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 RDH5Q92781 318 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 MUCL1Q96DR8 90 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 MSL2Q9HCI7 577 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 ZNF835Q9Y2P0 537 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 NAPSAO96009 420 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 KNG1P01042 644 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 ZNF81P51508 661 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 ERVK11-1P61568 191 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 MSMPQ1L6U9 139 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 Q6P435 159 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 SEC22AQ96IW7 307 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 Q9N2K0 584 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 ATMQ13315 3056 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 DEGS1O15121 323 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 HLA-GP17693 338 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 CXCL2P19875 107 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 FCGR2CP31995 323 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 SORDQ00796 357 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 C11orf53Q8IXP5 236 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 DECR2Q9NUI1 292 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 TMEM210A6NLX4 147 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 DBX1A6NMT0 343 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 FAM25EA8MYX2 175 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 RGS11O94810 467 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 PGA5P0DJD9 388 aa15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms