RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325103.10

HPS1-201, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-201ENST00000325103 IGHV3-13P01766 116 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 IGHV3-7P01780 117 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 TFF1P04155 84 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 TBPP20226 339 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 S100A11P31949 105 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 FAM27E3Q08E93 113 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 PPA1Q15181 289 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 CLEC18BQ6UXF7 455 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 SPACA3Q8IXA5 215 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 H0YL77 283 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 FCGR3AP08637 254 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 FGL1Q08830 312 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 BEND4Q6ZU67 534 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 TMUB2Q71RG4 321 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 ZNF680Q8NEM1 530 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 OR5A2Q8NGI9 324 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 LILRB4Q8NHJ6 448 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 RFESDQ8TAC1 157 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 RNF150Q9ULK6 438 aa11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 IFNA2P01563 188 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 OR8B8Q15620 311 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 FBXW12Q6X9E4 464 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 CDH26Q8IXH8 852 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 NINJ1Q92982 152 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 GLS2Q9UI32 602 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 MPC1Q9Y5U8 109 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 TPPPO94811 219 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 MPV17P39210 176 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 EDDM3BP56851 147 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 ZMYND11Q15326 602 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 GABRA6Q16445 453 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 ZNF767PQ75MW2 155 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 SLC25A42Q86VD7 318 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 ZNF695Q8IW36 515 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 ZDHHC22Q8N966 263 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 OR11L1Q8NGX0 322 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 OR6K3Q8NGY3 331 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 HPSE2Q8WWQ2 592 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 S100PBPQ96BU1 408 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 MED30Q96HR3 178 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 CACNA1BQ00975 2339 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 ZNF735P0CB33 412 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 IL2RGP31785 369 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 ZNF529Q6P280 563 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 TECTBQ96PL2 329 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 OCSTAMPQ9BR26 566 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 KCNIP1Q9NZI2 227 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 MED13LQ71F56 2210 aa11.13□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 OR14I1A6ND48 311 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 CD74P04233 296 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 SCTP09683 121 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 CECR9P0C854 216 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 CHATP28329 748 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 LUMP51884 338 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 SLC25A24Q6NUK1 477 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 SPICQ8N5J4 248 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 MELTFP08582 738 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 FPR2P25090 351 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 PSG7Q13046 419 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 FAM74A1Q5RGS3 127 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 ELP2Q6IA86 826 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 C5orf66Q9H5L9 145 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 WNT9BO14905 357 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 AADACP22760 399 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 CASP6P55212 293 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 C1orf185Q5T7R7 199 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 RAXQ9Y2V3 346 aa11.12□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 SMPD2O60906 423 aa11.11□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 AKR1C2P52895 323 aa11.11□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 SIGIRRQ6IA17 410 aa11.11□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 CMTM1Q8IZ96 169 aa11.11□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 SUMF2Q8NBJ7 301 aa11.11□□□□□ -0.63
HPS1-201ENST00000325103 OR10J5Q8NHC4 309 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms