RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 SORDQ00796 357 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 BAMBIQ13145 260 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 IL13RA2Q14627 380 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 OPCMLQ14982 345 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 SLC22A25Q6T423 547 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 TEX261Q6UWH6 196 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 DHRS11Q6UWP2 260 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 U3KQ87 197 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 CACNA1GO43497 2377 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 LRP5LA4QPB2 252 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 F8VVB4 439 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 F8VWA3 439 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 CALCRP30988 508 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 IKZF1Q13422 519 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 FAM169BQ8N8A8 192 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 DECR2Q9NUI1 292 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 LUZP4Q9P127 313 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 GTF3C1Q12789 2109 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 FAM221AA4D161 298 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 DBX1A6NMT0 343 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 FAM25EA8MYX2 175 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 CCSO14618 274 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 ARPC5O15511 151 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 IFNA7P01567 189 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 IGLV1-44P01699 117 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 PI3P19957 117 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 GLRA1P23415 457 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 TIMP3P35625 211 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 HTR2BP41595 481 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 GLP1RP43220 463 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 ERVS71-1P61550 626 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 Q6ZS49 121 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 FAM215AQ9Y5M1 114 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 OR5H1A6NKK0 313 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 GLAP06280 429 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 PSG7Q13046 419 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 GSG1LQ6UXU4 331 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 Q8IYB0 196 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 FAM57AQ8TBR7 257 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 RAB18Q9NP72 206 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 C5orf51A6NDU8 294 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 TMEM210A6NLX4 147 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 CECR9P0C854 216 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 SLC25A4P12235 298 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 RPA2P15927 270 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 S100A11P31949 105 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 FAM76BQ5HYJ3 339 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 NEK7Q8TDX7 302 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 SEC22AQ96IW7 307 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 MPC2O95563 127 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 KNG1P01042 644 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 ZNF728P0DKX0 622 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 OR8G1Q15617 311 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 TMEM65Q6PI78 240 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 TMUB2Q71RG4 321 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 SGPP2Q8IWX5 399 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 ZNF488Q96MN9 340 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 IFT22Q9H7X7 185 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 Q9N2K0 584 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 TMEM100Q9NV29 134 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 ACACBO00763 2458 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.48□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 NAPSAO96009 420 aa14.48□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 IFNA2P01563 188 aa14.48□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 FCGR2CP31995 323 aa14.48□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 SERPINF1P36955 418 aa14.48□□□□□ -0.09
SSR4-201ENST00000320857 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms