RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 GABRA2P47869 451 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF260Q3ZCT1 412 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLAC9Q5JTB6 97 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 C6orf201Q7Z4U5 140 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEK7Q8TDX7 302 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGFBPL1Q8WX77 278 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRRQ9GZT4 340 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFT22Q9H7X7 185 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 MCRIP1C9JLW8 97 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIRPB1O00241 398 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRDX2P32119 198 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS3P35030 304 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX36Q5VZQ5 186 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q6P435 159 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF581Q9P0T4 197 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM235A6NFC5 223 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERPINE3A8MV23 424 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 J3QRK9 145 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNG2P59768 71 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARFRP1Q13795 201 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNJ8Q15842 424 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 CARTPTQ16568 116 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q8N402 240 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIMD4Q96H15 378 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRBAP50851 2863 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 MFNGO00587 321 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTDSPLO15194 276 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 BRICD5Q6PL45 260 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8H2Q8N162 312 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUMF2Q8NBJ7 301 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCAMRQ8WWV6 532 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAAP24Q9BTP7 215 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIME1Q9H400 295 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHODLQ9H9P2 273 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSPB6O14558 160 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFS7O75251 213 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 RP2O75695 350 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLAP06280 429 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTHLHP12272 177 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 BTG1P62324 171 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 HACD4Q5VWC8 232 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB1CQ92928 201 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC32Q9BV29 185 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBE2QL1A1L167 161 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 NKX6-3A6NJ46 265 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 GYPAP02724 150 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 MELTFP08582 738 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL10A1Q03692 680 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANGPTL6Q8NI99 470 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 NRGNQ92686 78 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 BORCS5Q969J3 196 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 SULT4A1Q9BR01 284 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCHS2Q6V1P9 2916 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV24A0A0B4J272 114 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 GABARAPH6UMI1 98 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPIHO43447 177 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD3GP09693 182 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 STUMQ69YW2 141 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 RTN4RL2Q86UN3 420 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD177Q8N6Q3 437 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R35Q8TAP8 253 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 ST8SIA4Q92187 359 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCPEP1Q9HB40 452 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNK7Q9Y2U2 307 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 SULT1C2O00338 296 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 LMO1P25800 156 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM33P57088 247 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 C16orf87Q6PH81 154 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 BPIFB2Q8N4F0 458 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMIM4Q8WVI0 70 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF665Q9H7R5 613 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 ISPDA4D126 451 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 CA11O75493 328 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 LPLP06858 475 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 MDH2P40926 338 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 INPP1P49441 399 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP5J2P56134 94 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 DGCR2P98153 550 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZMYND11Q15326 602 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIQKQ629K1 86 aa22.95■■□□□ 1.26
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