RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 SSSCA1O60232 199 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 IL33O95760 270 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 HPRT1P00492 218 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 BCL2P10415 239 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 GZMHP20718 246 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 BRS3P32247 399 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TSPAN7P41732 249 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 WASP42768 502 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 FUT7Q11130 342 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 OR5I1Q13606 314 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 RTL6Q6ICC9 239 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 LRP11Q86VZ4 500 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CCL4L1Q8NHW4 92 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 PROB1E7EW31 1015 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 HCRTR1O43613 425 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CA11O75493 328 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CTSBP07858 339 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 SELEP16581 610 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 GALR1P47211 349 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 RRADP55042 308 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 GNB2P62879 340 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 KISS1Q15726 138 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ZBP1Q9H171 429 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CHST11Q9NPF2 352 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 GLRX2Q9NS18 164 aa6.3□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CD82P27701 267 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 GPM6BQ13491 265 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CST6Q15828 149 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF787Q6DD87 383 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TBX15Q96SF7 602 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 A0A1W2PPQ1 181 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 H7BYZ3 331 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CEACAM1P13688 526 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 PGCP20142 388 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 IL11P20809 199 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 OPRM1P35372 400 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 WNT5AP41221 380 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 DCAF7P61962 342 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 LCN15Q6UWW0 184 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ASB10Q8WXI3 467 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 MED29Q9NX70 200 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 F5P12259 2224 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM131Q92545 1883 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 A0A1W2PQU0 124 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 LNP1A1A4G5 178 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 MSTNO14793 375 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 SLC31A1O15431 190 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 LCATP04180 440 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF17P17021 662 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 VIPR2P41587 438 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TNFSF10P50591 281 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms