RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 PLCXD3Q63HM9 321 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 OR56B2PQ8NGI1 322 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 OR51T1Q8NGJ9 327 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 PIGCQ92535 297 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 METTL9Q9H1A3 318 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 B9A039 149 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 J3QW42 95 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 NGFP01138 241 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 FCER2P06734 321 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 NAT1P18440 290 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 CPT2P23786 658 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 MPZP25189 248 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ATP1B3P54709 279 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 GNG2P59768 71 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 MAB21L1Q13394 359 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 MEF2DQ14814 521 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 MOB3CQ70IA8 216 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 SLC30A7Q8NEW0 376 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 PXT1Q8NFP0 134 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 OR11H7Q8NGC8 314 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 FAM168AQ92567 244 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 Q96M66 194 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 GINS4Q9BRT9 223 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 IL36GQ9NZH8 169 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 M0QYG6 137 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 CD5LO43866 347 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 CA11O75493 328 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 CST4P01036 141 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 HPXP02790 462 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 TBPP20226 339 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 RAD52P43351 418 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 DSCR9P59020 149 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ARL6IP1Q15041 203 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 BEST4Q8NFU0 473 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 POFUT1Q9H488 388 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 BEX1Q9HBH7 125 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 IFT46Q9NQC8 304 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 PTTG3PQ9NZH4 202 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ATRQ13535 2644 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 VWC2LB2RUY7 222 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 NOXA1Q86UR1 476 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 OR4S1Q8NGB4 309 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ST8SIA4Q92187 359 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ANGPTL7O43827 346 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 C1QBP02746 253 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 AMY2AP04746 511 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 CBX5P45973 191 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ZMYND11Q15326 602 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 RSU1Q15404 277 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 TBC1D28Q2M2D7 210 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 PECRQ9BY49 303 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 GPR160Q9UJ42 338 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SERPINE3A8MV23 424 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 CRLF1O75462 422 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 IGKV1D-12P01611 117 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SLC25A16P16260 332 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 PPOXP50336 477 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 PRDX4Q13162 271 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 FTMTQ8N4E7 242 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SNAPC3Q92966 411 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HOXC6-201ENST00000243108 SLC6A7Q99884 636 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.7 ms