RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 STX19Q8N4C7 294 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 RFT1Q96AA3 541 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 SIRT7Q9NRC8 400 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 ZNF281Q9Y2X9 895 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 KDM4BO94953 1096 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 IGKV1D-12P01611 117 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 HCKP08631 526 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 MYF6P23409 242 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 GUCA2AQ02747 115 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 ZNF146Q15072 292 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 KISS1Q15726 138 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 SPIN3Q5JUX0 258 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 ASPHD2Q6ICH7 369 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 FAM185AQ8N0U4 392 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 TBC1D15Q8TC07 691 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 TNFRSF14Q92956 283 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 NOX4Q9NPH5 578 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa20.42■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa20.42■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 RAB3AP20336 220 aa20.42■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 SOX2P48431 317 aa20.42■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 GHSRQ92847 366 aa20.42■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 TMEM106AQ96A25 262 aa20.42■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 HMG20AQ9NP66 347 aa20.42■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 IL36RNQ9UBH0 155 aa20.42■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PPH5 198 aa20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 ANGPTL7O43827 346 aa20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 HAND1O96004 215 aa20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 TAS2R43P59537 309 aa20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 ZP1P60852 638 aa20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 SLC9A3R2Q15599 337 aa20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 NCR3LG1Q68D85 454 aa20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 OR8H2Q8N162 312 aa20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 OR5D18Q8NGL1 313 aa20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 OR5D13Q8NGL4 314 aa20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 SNX22Q96L94 193 aa20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 PGLYRP3Q96LB9 341 aa20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 ZNF696Q9H7X3 374 aa20.41■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 PRKACAP17612 351 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 WNT4P56705 351 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 ACTG1P63261 375 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 RNLSQ5VYX0 342 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 TMEM200BQ69YZ2 307 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 Q6YL49 198 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 PDZD9Q8IXQ8 264 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 PIP4P2Q8N4L2 257 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 ZDHHC16Q969W1 377 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 SLC25A28Q96A46 364 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 DUX5Q96PT3 197 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 TMEM82A0PJX8 343 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 TMEM89A2RUT3 159 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 MYL12BO14950 172 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 YIF1BQ5BJH7 314 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 C17orf107Q6ZR85 190 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 NANOGP1Q8N7R0 232 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 OR4M1Q8NGD0 313 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 OR51A2Q8NGJ7 313 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 TAS2R4Q9NYW5 299 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 GLS2Q9UI32 602 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 MAGEB3O15480 346 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 ALDOBP05062 364 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 COMPP49747 757 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 ERGIC3Q9Y282 383 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 CD1AP06126 327 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 CDK1P06493 297 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 TMEM225BP0DP42 221 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 UBE2E1P51965 193 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 DLX1P56177 255 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 GDPD3Q7L5L3 318 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 C11orf42Q8N5U0 333 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 ZFP41Q8N8Y5 198 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 PXT1Q8NFP0 134 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 OR13C5Q8NGS8 318 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 SCN3BQ9NY72 215 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 A0A0U1RQK1 487 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 A6NHS1 94 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 MELTFP08582 738 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 DUSP1P28562 367 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 BDH1Q02338 343 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 KLRD1Q13241 179 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 ZNF273Q14593 569 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 Q499Y3 187 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 TMEM86BQ8N661 226 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 MYDGFQ969H8 173 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 CDCA4Q9BXL8 241 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms