RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 OR2A4O95047 310 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 GLRX5Q86SX6 157 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 ZG16BQ96DA0 208 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 OR2A7Q96R45 310 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 OR2A5Q96R48 311 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 P2RX4Q99571 388 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 A0A0A6YYD5 115 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 A0A1W2PR48 441 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 ADAM20O43506 726 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 PITX3O75364 302 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 BMI1P35226 326 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 IL11RAQ14626 422 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 SSX8Q7RTT4 187 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 FGF22Q9HCT0 170 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 B9D1Q9UPM9 204 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 METTL12A8MUP2 240 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 IL2RAP01589 272 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 SFTPCP11686 197 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 GALNSP34059 522 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 DYNLT3P51808 116 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 OSR2Q8N2R0 312 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 SNCGO76070 127 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 LINC00614P0C842 121 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 BCL2P10415 239 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 RHOBP62745 196 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 MICBQ29980 383 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 WDR38Q5JTN6 314 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 WDR34Q96EX3 536 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 WNT16Q9UBV4 365 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 C11orf94C9JXX5 98 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 CDS2O95674 445 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 TRGC1P0CF51 173 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 CLDN15P56746 228 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 LPAL2Q16609 132 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.12□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 TMPRSS11DO60235 418 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 FOLR2P14207 255 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 HTR1DP28221 377 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 GLIPR1P48060 266 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 CCL11P51671 97 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 SPSB1Q96BD6 273 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 AQP10Q96PS8 301 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 C12orf49Q9H741 205 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 HSF4Q9ULV5 492 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 MYO10Q9HD67 2058 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 APCSP02743 223 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 OPN1LWP04000 364 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 FAM87AP0C7U9 286 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 SHBQ15464 509 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 Q5BKY6 102 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 PTX4Q96A99 478 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 IL19Q9UHD0 177 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.11□□□□□ -1.43
CLCN3-211ENST00000613795 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.11□□□□□ -1.43
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