RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882	MRI1	Q9BV20	369 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	KDM4B	O94953	1096 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	CRYAA	P02489	173 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	C4BPB	P20851	252 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	H2BFS	P57053	126 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	DHODH	Q02127	395 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	HGFAC	Q04756	655 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	CXorf58	Q96LI9	332 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	AMELY	Q99218	206 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	UBE2QL1	A1L167	161 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC16A7	O60669	478 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR2A4	O95047	310 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	WNT11	O96014	354 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC25A1	P53007	311 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	SSX9	Q7RTT3	188 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	LRP11	Q86VZ4	500 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	COQ8A	Q8NI60	647 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	LINC00052	Q96N35	136 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR2A7	Q96R45	310 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	OPN4	Q9UHM6	478 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882		H7C417	338 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	XRCC3	O43542	346 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	IL5	P05113	134 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	STAG3L3	P0CL85	134 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF35	P13682	527 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF611	Q8N823	705 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR8S1	Q8NH09	359 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCNK17	Q96T54	332 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARL6	Q9H0F7	186 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	KIF25	Q9UIL4	384 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882		A0A0U1RQV5	110 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	GGT3P	A6NGU5	568 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	GOSR2	O14653	212 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	KIR3DL2	P43630	455 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	GPR148	Q8TDV2	347 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	MARCH11	A6NNE9	402 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	XKRY	O14609	159 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	IGHV4-39	P01824	125 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	NMB	P08949	121 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR4A8	P0C604	315 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	RD3L	P0DJH9	198 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	GTF2F2	P13984	249 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF32	P17041	273 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ALOX5AP	P20292	161 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	S100A11	P31949	105 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	THBS4	P35443	961 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	MNDA	P41218	407 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	HFE	Q30201	348 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	BIVM	Q86UB2	503 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	SSX3	Q99909	188 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	10.73	□□□□□ -0.69	9e-7	■□□□□ 10.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	RP2	O75695	350 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	IGKV3-15	P01624	115 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	HLA-DQA2	P01906	255 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	LYNX1	P0DP58	116 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	WDR38	Q5JTN6	314 aa		10.73	□□□□□ -0.69

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