RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 WBP4O75554 376 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 ZFPL1O95159 310 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 CLIC3O95833 236 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 MT-ND2P03891 347 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 CD2P06729 351 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 MDKP21741 143 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 NPBWR2P48146 333 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 SNU13P55769 128 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 EDDM3AQ14507 147 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 MIDNQ504T8 468 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 SPIN3Q5JUX0 258 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 OR8H2Q8N162 312 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 PNKDQ8N490 385 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 CNIH3Q8TBE1 160 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNRD1Q9P1U0 126 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 ANK2Q01484 3957 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 hADV38S2A0JD32 116 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 E9PI62 339 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 SH2D1BO14796 132 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 SULT1B1O43704 296 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 GPR137BO60478 399 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM225BP0DP42 221 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 CCL3L1P16619 93 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 DUSP1P28562 367 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 IL18R1Q13478 541 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF273Q14593 569 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 GRK1Q15835 563 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC58Q4VC31 144 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 C17orf107Q6ZR85 190 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 OR5D18Q8NGL1 313 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 OR5R1Q8NH85 324 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 SPACA5Q96QH8 159 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 GPER1Q99527 375 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 JAM3Q9BX67 310 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 RHOFQ9HBH0 211 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 C1RLQ9NZP8 487 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF737O75373 536 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 NDUFA7O95182 113 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 LIMS3P0CW19 117 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 LIMS4P0CW20 117 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF728P0DKX0 622 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 CALCBP10092 127 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 RAB3AP20336 220 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 COX7A1P24310 79 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 ETV1P50549 477 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF146Q15072 292 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 SAXO1Q8IYX7 474 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 PARP16Q8N5Y8 322 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 OR13D1Q8NGV5 346 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 GPR148Q8TDV2 347 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM80Q96HE8 168 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF649Q9BS31 505 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 HMG20AQ9NP66 347 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 VPREB3Q9UKI3 123 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 MMP24Q9Y5R2 645 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 TENM1Q9UKZ4 2725 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 FUOMA2VDF0 154 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 SIRPB1O00241 398 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 MGST3O14880 152 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 ALX3O95076 343 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF44P15621 663 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 SOX2P48431 317 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 SCN1BQ07699 218 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 KISS1Q15726 138 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 SATL1Q86VE3 508 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 BEND2Q8NDZ0 799 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF714Q96N38 554 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 CHST6Q9GZX3 395 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 SLITRK2Q9H156 845 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 BABAM2Q9NXR7 383 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 IL36RNQ9UBH0 155 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM82A0PJX8 343 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 CLPSL1A2RUU4 121 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 C17orf98A8MV24 154 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 KDM4BO94953 1096 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 RBP4P02753 201 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 CAPGP40121 348 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 CDK5R1Q15078 307 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 TAF9Q16594 264 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 OR2G6Q5TZ20 316 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-215ENST00000589825 OLFML2AQ68BL7 652 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms