RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF488Q96MN9 340 aa19.32■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SPACA1Q9HBV2 294 aa19.32■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 HES4Q9HCC6 221 aa19.32■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 MSL2Q9HCI7 577 aa19.32■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 DUSP13Q9UII6 198 aa19.32■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 POU2F3Q9UKI9 436 aa19.32■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 EDARQ9UNE0 448 aa19.32■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 CACNA1BQ00975 2339 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 HMX3A6NHT5 357 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 M0QYG6 137 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCD4O14678 606 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 CDIPTO14735 213 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 FCER2P06734 321 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 GRPP07492 148 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 PRKACAP17612 351 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 OR52W1Q6IF63 320 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 BPIFB2Q8N4F0 458 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 OR4K15Q8NH41 348 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC6A7Q99884 636 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 CA10Q9NS85 328 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ACACBO00763 2458 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 PEX14O75381 377 aa19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 AMY2AP04746 511 aa19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 VHLLQ6RSH7 139 aa19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 BATF2Q8N1L9 274 aa19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 PRRT1Q99946 306 aa19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SYT3Q9BQG1 590 aa19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNJ16Q9NPI9 418 aa19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 IL36RNQ9UBH0 155 aa19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 NDRG3Q9UGV2 375 aa19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 PCNX1Q96RV3 2341 aa19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 NKX2-6A6NCS4 301 aa19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 PRAF2O60831 178 aa19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 HRH1P35367 487 aa19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SNU13P55769 128 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 TAS2R46P59540 309 aa19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 MICBQ29980 383 aa19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6P435 159 aa19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 BEST4Q8NFU0 473 aa19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 MED30Q96HR3 178 aa19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 GHITMQ9H3K2 345 aa19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 TAAR3PQ9P1P4 343 aa19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ITPR1Q14643 2758 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 PLSCR5A0PG75 271 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 IL5P05113 134 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 AMY2BP19961 511 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 CFHR2P36980 270 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB25P57735 213 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF146Q15072 292 aa19.28■□□□□ 0.68
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CAPNS1-207ENST00000589146 CARTPTQ16568 116 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 C4orf17Q53FE4 359 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC22A25Q6T423 547 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ARRDC1Q8N5I2 433 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 OR2Z1Q8NG97 314 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10Z1Q8NGY1 313 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 GINS4Q9BRT9 223 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 FLVCR2Q9UPI3 526 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP23Q9Y6H3 246 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 CADP27708 2225 aa19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0A6YYJ9 748 aa19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 FCGR3AP08637 254 aa19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 IKZF1Q13422 519 aa19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 CDSNQ15517 529 aa19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ADIPOQQ15848 244 aa19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SPIN3Q5JUX0 258 aa19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ATAD3CQ5T2N8 411 aa19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR82Q6UXN9 313 aa19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 IDO2Q6ZQW0 420 aa19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6ZS49 121 aa19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 AKAP14Q86UN6 197 aa19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 OR13C8Q8NGS7 320 aa19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 OR5H2Q8NGV7 314 aa19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
CAPNS1-207ENST00000589146 POM121CA8CG34 1229 aa19.26■□□□□ 0.67
CAPNS1-207ENST00000589146 VSTM5A8MXK1 200 aa19.26■□□□□ 0.67
CAPNS1-207ENST00000589146 SHISA9B4DS77 424 aa19.26■□□□□ 0.67
CAPNS1-207ENST00000589146 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa19.26■□□□□ 0.67
CAPNS1-207ENST00000589146 NXPH2O95156 264 aa19.26■□□□□ 0.67
CAPNS1-207ENST00000589146 PMP2P02689 132 aa19.26■□□□□ 0.67
CAPNS1-207ENST00000589146 ADH4P08319 380 aa19.26■□□□□ 0.67
CAPNS1-207ENST00000589146 AGAP20933 346 aa19.26■□□□□ 0.67
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