RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 VASH2Q86V25 355 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 M0R036 132 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 DHHO43323 396 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 OPRM1P35372 400 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 CASRP41180 1078 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 OR14K1Q8NGZ2 314 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 CCDC107Q8WV48 283 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 SLC26A1Q9H2B4 701 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 BCO1Q9HAY6 547 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 PLA2G3Q9NZ20 509 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 UPB1Q9UBR1 384 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 IL17BQ9UHF5 180 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 M0R135 149 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 HOXB5P09067 269 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 TMEM225BP0DP42 221 aa13.13□□□□□ -0.31
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CTIF-205ENST00000587860 H3F3AP84243 136 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 IL11RAQ14626 422 aa13.13□□□□□ -0.31
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CTIF-205ENST00000587860 ZNF799Q96GE5 643 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 AKR1E2Q96JD6 320 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 GSKIPQ9P0R6 139 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 A0A096LPE4 126 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 A0A1W2PPZ6 126 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 CD74P04233 296 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 GLP1RP43220 463 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 MEF2DQ14814 521 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 IGFBP7Q16270 282 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 C3AR1Q16581 482 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 CRIP3Q6Q6R5 217 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 GPR61Q9BZJ8 451 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 PARPBPQ9NWS1 579 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa13.12□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 LCATP04180 440 aa13.12□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 AMY2BP19961 511 aa13.12□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 RAB4AP20338 218 aa13.12□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 ZBTB25P24278 435 aa13.12□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 SERPINF1P36955 418 aa13.12□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 RPS10P46783 165 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.12□□□□□ -0.31
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CTIF-205ENST00000587860 EFSO43281 561 aa13.12□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 CD80P33681 288 aa13.12□□□□□ -0.31
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CTIF-205ENST00000587860 HIST3H3Q16695 136 aa13.12□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
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CTIF-205ENST00000587860 C9JQL5 133 aa13.12□□□□□ -0.31
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CTIF-205ENST00000587860 FOXO1Q12778 655 aa13.12□□□□□ -0.31
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CTIF-205ENST00000587860 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa13.11□□□□□ -0.31
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CTIF-205ENST00000587860 GJC3Q8NFK1 279 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 PRRT1Q99946 306 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 FAAP24Q9BTP7 215 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 C5orf66Q9H5L9 145 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 EHFQ9NZC4 300 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 NPIPB13A6NJU9 1138 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 A6NNC1 897 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 NPIPB4C9JG80 1138 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-205ENST00000587860 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
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