RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 POC1AQ8NBT0 407 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SETD9Q8NE22 299 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 FGGYQ96C11 551 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 BORCS8Q96FH0 119 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SIRPDQ9H106 197 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 AMBNQ9NP70 447 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 NOX4Q9NPH5 578 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PPH5 198 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CYB5AP00167 134 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 PGA5P0DJD9 388 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 HKR1P10072 659 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ETV6P41212 452 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 KIR3DL2P43630 455 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ATP1B3P54709 279 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 MTCP1P56278 107 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CAV3P56539 151 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ACTA2P62736 377 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ACTG2P63267 376 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35A2P78381 396 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 GUCA2AQ02747 115 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF91Q05481 1191 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 IL24Q13007 206 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2V2Q15819 145 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 Q6YL49 198 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 AKAP14Q86UN6 197 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CALHM1Q8IU99 346 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF561Q8N587 486 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 FCGR1BQ92637 280 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SLAMF9Q96A28 289 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 C10orf35Q96D05 121 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 LGALS12Q96DT0 336 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 C4orf36Q96KX1 117 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ALG8Q9BVK2 526 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SCN3BQ9NY72 215 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0U1RQK1 487 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CLDN34H7C241 214 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 M0R1W7 72 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 PAHP00439 452 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ATF1P18846 271 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 PRKACBP22694 351 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 OMGP23515 440 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 POU3F4P49335 361 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 RBP2P50120 134 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DLX1P56177 255 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 GALEQ14376 348 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL22Q53GT1 634 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZSR3 168 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CD177Q8N6Q3 437 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 PP6455Q8WZ26 134 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SDSLQ96GA7 329 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CEP19Q96LK0 163 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 PKIBQ9C010 78 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CHST5Q9GZS9 411 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 NEK6Q9HC98 313 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms