RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 MICBQ29980 383 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 FAM78BQ5VT40 261 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 OR2D2Q9H210 308 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 NHSQ6T4R5 1651 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 PDCD6O75340 191 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 HRASP01112 189 aa18.94■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 C19orf57Q0VDD7 668 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 OR2C3Q8N628 320 aa18.94■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 PPP1CAP62136 330 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 LILRA6Q6PI73 481 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 OR10D3Q8NH80 312 aa18.93■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 LYRM7Q5U5X0 104 aa18.93■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 PCED1AQ9H1Q7 454 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 AAMDCQ9H7C9 122 aa18.93■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 OR4D11Q8NGI4 311 aa18.93■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa18.92■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 RPEL1Q2QD12 228 aa18.92■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 HES7Q9BYE0 225 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A22Q9H936 323 aa18.92■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 RBFOX3A6NFN3 312 aa18.9■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 SPCS3P61009 180 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 ACER2Q5QJU3 275 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 CD81P60033 236 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 WDR73Q6P4I2 378 aa18.9■□□□□ 0.62
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