RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575909.1

TOM1L1-222, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	USP27X	A6NNY8	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SIRPB1	O00241	398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PHOX2A	O14813	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAD51C	O43502	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	HCRTR1	O43613	425 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CHST1	O43916	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	GADD45G	O95257	159 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CNIH1	O95406	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	IFNA7	P01567	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	C1QC	P02747	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	IFNW1	P05000	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SERPINA7	P05543	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ALOX5AP	P20292	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	GZMH	P20718	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OMG	P23515	440 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	HTR1E	P28566	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TNFSF9	P41273	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	GPR1	P46091	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RGR	P47804	291 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR3A4P	P47883	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRLHR	P49683	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SULT1A1	P50225	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SULT1A2	P50226	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	GALNT10	Q86SR1	603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM25	Q86YD3	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	FTMT	Q8N4E7	242 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAB8B	Q92930	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR7D2	Q96RA2	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PIK3C2G	O75747	1445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	MAP3K1	Q13233	1512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SYNM	O15061	1565 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A0X1KG70	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A1W2PP64	1363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC22A20	A6NK97	555 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CLDN25	C9JDP6	229 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909		F6UZH7	168 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	COPE	O14579	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	HSD17B6	O14756	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TNFSF11	O14788	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	MED14	O60244	1454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	GPR75	O95800	540 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF30	P17039	623 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ETV6	P41212	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CX3CR1	P49238	355 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	EVX1	P49640	407 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	DIO3	P55073	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	C2orf80	Q0P641	193 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	GK3P	Q14409	553 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PMVK	Q15126	192 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	AVPI1	Q5T686	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC35F6	Q8N357	371 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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