RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR2G6Q5TZ20 316 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 TPRX1Q8N7U7 411 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 DYRK2Q92630 601 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 DHDHQ9UQ10 334 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SIRPB1O00241 398 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ACSM1Q08AH1 577 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 GRK1Q15835 563 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 XAF1Q6GPH4 301 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 Q8IYB0 196 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR8H2Q8N162 312 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR4F5Q8NH21 305 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SNX22Q96L94 193 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A1W2PPE2 198 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A1W2PR64 198 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A1W2PRV1 198 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 PSPNO60542 156 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTC23Q5W5X9 447 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SERPINA12Q8IW75 414 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR4S1Q8NGB4 309 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 BEX1Q9HBH7 125 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 HMG20AQ9NP66 347 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 FBN3Q75N90 2809 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANK2Q01484 3957 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 POM121CA8CG34 1229 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SULT1B1O43704 296 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 MT-ND2P03891 347 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM225BP0DP42 221 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 DCKP27707 260 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SCN1BQ07699 218 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 IL18R1Q13478 541 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR5D14Q8NGL3 314 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ING3Q9NXR8 418 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 GLS2Q9UI32 602 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 VPREB3Q9UKI3 123 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 H3BUX3 64 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 KDM4BO94953 1096 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 NDUFA7O95182 113 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF728P0DKX0 622 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYL12AP19105 171 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 DLX6P56179 175 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF146Q15072 292 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 LY6EQ16553 131 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 MIDNQ504T8 468 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLA1AQ53H76 456 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 TCF23Q7RTU1 214 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SATL1Q86VE3 508 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SETD9Q8NE22 299 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SSX3Q99909 188 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 JAM3Q9BX67 310 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 C8orf4Q9NR00 106 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 hADV38S2A0JD32 116 aa14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 IRGMA1A4Y4 181 aa14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 C17orf98A8MV24 154 aa14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR2H2O95918 312 aa14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 GNAO1P09471 354 aa14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF44P15621 663 aa14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 LGALS4P56470 323 aa14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDK5R1Q15078 307 aa14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 KISS1Q15726 138 aa14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM80Q96HE8 168 aa14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 AJUBAQ96IF1 538 aa14.46□□□□□ -0.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF714Q96N38 554 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms