RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 IL2RAP01589 272 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 BCL3P20749 454 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD82P27701 267 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHATP28329 748 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 DUSP1P28562 367 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR3A2P47893 321 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 PCP4P48539 62 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 FUT6P51993 359 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ERVS71-1P61550 626 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ASCL4Q6XD76 172 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 STPG2Q8N412 459 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 TAAR6Q96RI8 345 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 OSGIN2Q9Y236 505 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 KALRNO60229 2985 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 K7EM74 188 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ADAP1O75689 374 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHRFAM7AQ494W8 412 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 OSR2Q8N2R0 312 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR5AP2Q8NGF4 316 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR10Z1Q8NGY1 313 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 MITD1Q8WV92 249 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 RGCCQ9H4X1 137 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 HMSDA8MTL9 139 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SERPINE3A8MV23 424 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSPB6O14558 160 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SYNGR1O43759 233 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV1-2P23083 117 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 MPGP29372 298 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 FOXF2Q12947 444 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 IKZF1Q13422 519 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 VWA1Q6PCB0 445 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCDC54Q8NEL0 328 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPA2Q9H2U2 334 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 PQLC2LA1A4F0 135 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 RFPL4AA6NLU0 287 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRR33A8MZF0 331 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 KNG1P01042 644 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 TBPP20226 339 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR2T2Q6IF00 324 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 BEND4Q6ZU67 534 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR1S1Q8NH92 325 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 MTCH1Q9NZJ7 389 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 CUL9Q8IWT3 2517 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 GTF3C1Q12789 2109 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF732B4DXR9 585 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 FCGR3AP08637 254 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 MPPED2Q15777 294 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ALKBH6Q3KRA9 238 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF391Q9UJN7 358 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD300LBA8K4G0 201 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 AGFG2O95081 481 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 GLI4P10075 376 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPS2P15880 293 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SELEP16581 610 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ARR3P36575 388 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SERPINF1P36955 418 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 TFAP2EQ6VUC0 442 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC30A7Q8NEW0 376 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIF25Q9UIL4 384 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNF222A6NCQ9 220 aa8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms