RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYP51A1Q16850 503 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC80Q76M96 950 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR86Q86TI4 376 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 MED31Q9Y3C7 131 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 EVPLLA8MZ36 301 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 IMPA2O14732 288 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACSM4P0C7M7 580 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 GZMMP51124 257 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBE2E1P51965 193 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAS2R41P59536 307 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR8B8Q15620 311 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRT71Q3SY84 523 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 STUMQ69YW2 141 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 EPGNQ6UW88 154 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 MREGQ8N565 214 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 PIFOQ8TCI5 191 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 DUX3Q96PT4 197 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SYT4Q9H2B2 425 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAB18Q9NP72 206 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRR32B1ATL7 298 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDC42EP2O14613 210 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CIDEAO60543 219 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 PAHP00439 452 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CD14P08571 375 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 IFI30P13284 250 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CA6P23280 308 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC9A3P48764 834 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 STX1BP61266 288 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 LY6EQ16553 131 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 NRMQ8IXM6 262 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 RORBQ92753 470 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRRC1Q96M27 445 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q96M85 177 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CGREF1Q99674 301 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SSX3Q99909 188 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC22A4Q9H015 551 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 RYR1P21817 5038 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1W2PRD5 423 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1W2PRF3 423 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1W2PRM7 423 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 CD300LBA8K4G0 201 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 M0R1W7 72 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 DCTN6O00399 190 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 GMDSO60547 372 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 PAX6P26367 422 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 FXYD6P3P58550 94 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC35A2P78381 396 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR8G1Q15617 311 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 MEP1BQ16820 701 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 TEX38Q6PEX7 206 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR82Q6UXN9 313 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 PGAP1Q75T13 922 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADCK1Q86TW2 530 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 MICU2Q8IYU8 434 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR51A7Q8NH64 312 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 SGK494Q96LW2 274 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 EBF4Q9BQW3 602 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-204ENST00000559861 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms