RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 LMO1P25800 156 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 GIFP27352 417 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 CDKN1AP38936 164 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 PDLIM4P50479 330 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 ATP5J2P56134 94 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 CLDN12P56749 244 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 BTG1P62324 171 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 ZNF45Q02386 682 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 UNC119Q13432 240 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 DMRTC1Q5HYR2 192 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 SPICQ8N5J4 248 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 Q96M66 194 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 OR2AT4A6NND4 320 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 SERPINE3A8MV23 424 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 XRCC3O43542 346 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 RP2O75695 350 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 HEXAP06865 529 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 ETV6P41212 452 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 MNDAP41218 407 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 NPBWR2P48146 333 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 PTH2RP49190 550 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 SHEQ5VZ18 495 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 ZNF561Q8N587 486 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 TMEM104Q8NE00 496 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 TREM2Q9NZC2 230 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 MIOXQ9UGB7 285 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 FABP12A6NFH5 140 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 CTDSP2O14595 271 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 HPGDSO60760 199 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 PDCD6O75340 191 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 PAHP00439 452 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 IGHV4-39P01824 125 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 ELK1P19419 428 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 COL8A2P25067 703 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 PRDX2P32119 198 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 TNFSF8P32971 234 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 NPY4RP50391 375 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 IL13RA1P78552 427 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 IKZF1Q13422 519 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 Q6ZTK2 550 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 RNF144BQ7Z419 303 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 OR5H6Q8NGV6 325 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 FAM168AQ92567 244 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 RAB3CQ96E17 227 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 SDSLQ96GA7 329 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 BANF2Q9H503 90 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 SPG11Q96JI7 2443 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 ARID1AO14497 2285 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 AKAP6Q13023 2319 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 A0A0B4J203 849 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-220ENST00000550700 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
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