RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	NDUFA2	O43678	99 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	HAND1	O96004	215 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	PITPNB	P48739	271 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	UNC119	Q13432	240 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	PIGY	Q3MUY2	71 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	SPIC	Q8N5J4	248 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM104	Q8NE00	496 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658		Q96M66	194 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	CMTM3	Q96MX0	182 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	MMP27	Q9H306	513 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658		F8VVB4	439 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658		F8VWA3	439 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	SIRPB1	O00241	398 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	DEGS1	O15121	323 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	HPGDS	O60760	199 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV2-70	P01814	119 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	GYPA	P02724	150 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	HEXA	P06865	529 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	CHRM2	P08172	466 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	PSG2	P11465	335 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	VEGFC	P49767	419 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF146	Q15072	292 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	ZMYND11	Q15326	602 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	TAF9	Q16594	264 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658		Q5PR19	223 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	RAB12	Q6IQ22	244 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	CHST4	Q8NCG5	386 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658		Q8NFD4	153 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	NEK7	Q8TDX7	302 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	SEH1L	Q96EE3	360 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	POM121	Q96HA1	1249 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	TM2D1	Q9BX74	207 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	DIABLO	Q9NR28	239 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	LDLRAD4	O15165	306 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	ADAM20	O43506	726 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	CLPX	O76031	633 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	FSTL3	O95633	263 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	OR2H2	O95918	312 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	APOA1	P02647	267 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	GIF	P27352	417 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	DUSP1	P28562	367 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	PRDX2	P32119	198 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	IL13RA1	P78552	427 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	QRFP	P83859	136 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	ARL6IP1	Q15041	203 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	STUM	Q69YW2	141 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF561	Q8N587	486 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	MED30	Q96HR3	178 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	OR8B2	Q96RD0	313 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		9.96	□□□□□ -0.82

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