RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 GALEQ14376 348 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 GRK1Q15835 563 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 KLHL22Q53GT1 634 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 PLA1AQ53H76 456 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 FDX2Q6P4F2 183 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 OR8H2Q8N162 312 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ZNF555Q8NEP9 628 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 RFT1Q96AA3 541 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 LGALS12Q96DT0 336 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 PELI1Q96FA3 418 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ZNF714Q96N38 554 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 OPALINQ96PE5 141 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 SPACA5Q96QH8 159 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 MBOAT4Q96T53 435 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 SLC29A1Q99808 456 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 CITED1Q99966 193 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ALG8Q9BVK2 526 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 CHST6Q9GZX3 395 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 C16orf95Q9H693 158 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 NEK6Q9HC98 313 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 S100A14Q9HCY8 104 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 TMEM82A0PJX8 343 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ZNF737O75373 536 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 IGHA1P01876 353 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 HCKP08631 526 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 DBTP11182 482 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 GABRA5P31644 462 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 RAB13P51153 203 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 PROK1P58294 105 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ZNF91Q05481 1191 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 FAM189A2Q15884 450 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 SSX2Q16385 188 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 UTS2BQ765I0 119 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 OR10AC1Q8NH08 325 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 OR5AK2Q8NH90 309 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 SPSB1Q96BD6 273 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 RAB18Q9NP72 206 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 FAM118AQ9NWS6 357 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 TGP01266 2768 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 OR4C45A6NMZ5 311 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 E9PQ18 207 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 SIRPB1O00241 398 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 MGST3O14880 152 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 MAGEB3O15480 346 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 PSPNO60542 156 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 TMEM225BP0DP42 221 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 GABRB1P18505 474 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 DLX6P56179 175 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 RAB40BQ12829 278 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ZNF146Q15072 292 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 AANATQ16613 207 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 SATL1Q86VE3 508 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 DTX3Q8N9I9 347 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 STMN2Q93045 179 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 MALSU1Q96EH3 234 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 AJUBAQ96IF1 538 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 HMG20AQ9NP66 347 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 INPP5EQ9NRR6 644 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ING3Q9NXR8 418 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms