RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 LAP3P28838 519 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 AKR1D1P51857 326 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 RAB1AP62820 205 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 SQSTM1Q13501 440 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 BEX5Q5H9J7 111 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 OR52W1Q6IF63 320 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 BEND4Q6ZU67 534 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 DOK3Q7L591 496 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 MARCH3Q86UD3 253 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 C1QL4Q86Z23 238 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 OR5AS1Q8N127 324 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 LRTM2Q8N967 370 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 OR8G5Q8NG78 346 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 MBD6Q96DN6 1003 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 GPR87Q9BY21 358 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 TCFL5Q9UL49 500 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 EDARQ9UNE0 448 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.26□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 A0A0A6YYD4 124 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 MSGN1A6NI15 193 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF878C9JN71 531 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 SIGLEC5O15389 551 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 PMP2P02689 132 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 SFTA3P0C7M3 94 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 NR2C1P13056 603 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 GNB3P16520 340 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF708P17019 499 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF20P17024 532 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 GNALP38405 381 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 PTGFRP43088 359 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 LPAR6P43657 344 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 P2RY4P51582 365 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 ARHGDIBP52566 201 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM50BP56557 158 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 HSF1Q00613 529 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 HGFACQ04756 655 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 RHEBQ15382 184 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 OR7A5Q15622 319 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 DNLZQ5SXM8 178 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 GPR157Q5UAW9 335 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 LCN10Q6JVE6 187 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 LFNGQ8NES3 379 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 CMBLQ96DG6 245 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 KIRREL1Q96J84 757 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 TGM7Q96PF1 710 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 TAAR6Q96RI8 345 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.25□□□□□ -1.41
SMIM20-202ENST00000514384 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms