RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512392.5

CHD1-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene CHD1, Length 1,968 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD1-208	ENST00000512392	FSHB	P01225	129 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	ALPL	P05186	524 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	CD34	P28906	385 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	MIP	P30301	263 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	SERPINB10	P48595	397 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	CRYBA2	P53672	197 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	GTF2B	Q00403	316 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	CARM1	Q86X55	608 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	NPW	Q8N729	165 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	OR10D3	Q8NH80	312 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	MCFD2	Q8NI22	146 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	SPACA5	Q96QH8	159 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	PANK3	Q9H999	370 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD1-208	ENST00000512392	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392		A0A1B0GXF2	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	IFNG	P01579	166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CD79A	P11912	226 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	PROZ	P22891	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	SDC4	P31431	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RARRES1	P49788	294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	DEFA1	P59665	94 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	GNG2	P59768	71 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	TBPL1	P62380	186 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	NSDHL	Q15738	373 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	GPR26	Q8NDV2	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	POMK	Q9H5K3	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ARAP1	Q96P48	1450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392		H7C417	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392		K7ENP7	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	SLC17A2	O00624	439 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	EDIL3	O43854	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	REM1	O75628	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	DRD3	P35462	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	NDUFA8	P51970	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	MTPN	P58546	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	GAGE5	Q13069	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	GAGE6	Q13070	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	IHH	Q14623	411 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	REEP6	Q96HR9	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	NANOG	Q9H9S0	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392		A0A087WX48	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	CRLF1	O75462	422 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	YIF1A	O95070	293 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD1-208	ENST00000512392	EPPIN	O95925	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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