RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 LRRTM1Q86UE6 522 aa11.16□□□□□ -0.62
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PGGT1B-204ENST00000503638 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
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PGGT1B-204ENST00000503638 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
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PGGT1B-204ENST00000503638 DUX4Q9UBX2 424 aa11.16□□□□□ -0.62
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PGGT1B-204ENST00000503638 OR10A3P58181 314 aa11.13□□□□□ -0.63
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PGGT1B-204ENST00000503638 PRR20AP86496 221 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 EDDM3AQ14507 147 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 PDCD1Q15116 288 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 CRIP3Q6Q6R5 217 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 BTN2A1Q7KYR7 527 aa11.13□□□□□ -0.63
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