RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 RORCP51449 518 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 OR2B6P58173 313 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 VBP1P61758 197 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 B2MP61769 119 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 NCS1P62166 190 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 LIPEQ05469 1076 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ECH1Q13011 328 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 BAMBIQ13145 260 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 MLIPQ5VWP3 458 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 NXNL2Q5VZ03 156 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM236Q5W0B7 351 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 CYB5R2Q6BCY4 276 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF621Q6ZSS3 439 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF767PQ75MW2 155 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 PLCZ1Q86YW0 608 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 TCTE3Q8IZS6 198 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF567Q8N184 647 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ZADH2Q8N4Q0 377 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 DEFB119Q8N690 84 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 OR10G9Q8NGN4 311 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 OR2G3Q8NGZ4 309 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 OR5K1Q8NHB7 308 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 MCFD2Q8NI22 146 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 LHFPL5Q8TAF8 219 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ZFAND1Q8TCF1 268 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM158Q8WZ71 300 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 RORBQ92753 470 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 SLC38A4Q969I6 547 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC126Q96EE4 140 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC115Q96NT0 180 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 CSPG4P5Q96PW8 444 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 PITX2Q99697 317 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC32Q9BV29 185 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 CALN1Q9BXU9 219 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 GPR61Q9BZJ8 451 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 CYP3A43Q9HB55 503 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ACOT13Q9NPJ3 140 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 STMN3Q9NZ72 180 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF229Q9UJW7 825 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ACOT9Q9Y305 439 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 STARD10Q9Y365 291 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 PCM1Q15154 2024 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 SHANK1Q9Y566 2161 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 PCNX1Q96RV3 2341 aa2.9□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 LRP4O75096 1905 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 DOCK9Q9BZ29 2069 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1B0GTQ1 180 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 SMCO3A2RU48 225 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 PDZK1P1A8MUH7 402 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 SLC31A2O15432 143 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 DPM1O60762 260 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 FTH1P02794 183 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 APODP05090 189 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 RBP1P09455 135 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 IL7P13232 177 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 MGMTP16455 207 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 CRISP2P16562 243 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ERP29P30040 261 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 TGFBR1P36897 503 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 TALDO1P37837 337 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 TNFSF9P41273 254 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 MAGEA2P43356 314 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 MAP2K4P45985 399 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 NPBWR2P48146 333 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 TUFMP49411 452 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 GZMMP51124 257 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 OR4D2P58180 307 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 TAS2R39P59534 338 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 RAB10P61026 200 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 SMARCB1Q12824 385 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ILKQ13418 452 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 RCAN2Q14206 197 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 FZD2Q14332 565 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 PSG5Q15238 335 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ZBTB6Q15916 424 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 IMPG1Q17R60 797 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 XKR7Q5GH72 579 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF678Q5SXM1 525 aa2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms