RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 GLIPR1P48060 266 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ACTA2P62736 377 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ACTG2P63267 376 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ACTC1P68032 377 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ACTA1P68133 377 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF91Q05481 1191 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 AESQ08117 197 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 HERPUD1Q15011 391 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 GRK1Q15835 563 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OR8H2Q8N162 312 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OR2G2Q8NGZ5 317 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OR5R1Q8NH85 324 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 CFHR4Q92496 578 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 LEAP2Q969E1 77 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 BORCS8Q96FH0 119 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 PKIBQ9C010 78 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 CHST5Q9GZS9 411 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 TCF19Q9Y242 345 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 E9PQ18 207 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ALPLP05186 524 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ATF1P18846 271 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ATP6V1E1P36543 226 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 LGALS4P56470 323 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 SLC34A1Q06495 639 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 IL18R1Q13478 541 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF626Q68DY1 528 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 XAF1Q6GPH4 301 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 Q6ZTK2 550 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 PELI1Q96FA3 418 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 COQ2Q96H96 371 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 C4orf36Q96KX1 117 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF714Q96N38 554 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 SLC29A1Q99808 456 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 DAPL1A0PJW8 107 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OR4C45A6NMZ5 311 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OR2H2O95918 312 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 CHRM2P08172 466 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 GABRB1P18505 474 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 FUT6P51993 359 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 MTCP1P56278 107 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 DOC2BQ14184 412 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OCLNQ16625 522 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ZSCAN26Q16670 478 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 LTC4SQ16873 150 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 Q6ZPA2 131 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 CBR4Q8N4T8 237 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 UBALD1Q8TB05 177 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 NDNFQ8TB73 568 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 LGALS12Q96DT0 336 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 SNX22Q96L94 193 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 MNTQ99583 582 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF649Q9BS31 505 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ADI1Q9BV57 179 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 PRRG3Q9BZD7 231 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1W2PPE3 182 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 SLC16A6O15403 523 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 SULT1C4O75897 302 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 CLIC3O95833 236 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms