RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491203.5

CNOT4-210, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 4

Gene CNOT4, Length 538 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-210ENST00000491203 NR4A2P43354 598 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 NPBWR2P48146 333 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 BMXP51813 675 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 ERVK11-1P61568 191 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 GPR176Q14439 515 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 ZMYND11Q15326 602 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 P2RY14Q15391 338 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 KCNJ8Q15842 424 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 MICBQ29980 383 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 HES5Q5TA89 166 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 ASCL4Q6XD76 172 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 DNM1P46Q6ZS02 220 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 USP43Q70EL4 1123 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 C1QL4Q86Z23 238 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 Q96MF0 132 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 WDR13Q9H1Z4 485 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 RHOFQ9HBH0 211 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 IL36GQ9NZH8 169 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 NLKQ9UBE8 527 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 GHRLQ9UBU3 117 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 A0A0G2JK05 382 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 IFITM5A6NNB3 132 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 VWC2LB2RUY7 222 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 F8VVB4 439 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 F8VWA3 439 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 AIPO00170 330 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 FSTL3O95633 263 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 KNG1P01042 644 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 IGHV2-70P01814 119 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 CSTBP04080 98 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 SFTPBP07988 381 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 CALCBP10092 127 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 PRKACAP17612 351 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 SERPINA2P20848 420 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 CFPP27918 469 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 CAV3P56539 151 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 CLDN12P56749 244 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 FGF12P61328 243 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 DGUOKQ16854 277 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF404Q494X3 552 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 FAM166AQ6J272 317 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 CROCCP3Q8IVE0 287 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 SPICQ8N5J4 248 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 NDNFQ8TB73 568 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 ISOC1Q96CN7 298 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 SEH1LQ96EE3 360 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 GAL3ST1Q99999 423 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 CST11Q9H112 138 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM165Q9HC07 324 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 HES4Q9HCC6 221 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 HMG20AQ9NP66 347 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 GLS2Q9UI32 602 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-210ENST00000491203 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-210ENST00000491203 PDZD2O15018 2839 aa7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-210ENST00000491203 DPPA5A6NC42 116 aa7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-210ENST00000491203 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-210ENST00000491203 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-210ENST00000491203 OR2AT4A6NND4 320 aa7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-210ENST00000491203 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-210ENST00000491203 NDUFA2O43678 99 aa7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-210ENST00000491203 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-210ENST00000491203 GYPAP02724 150 aa7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-210ENST00000491203 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-210ENST00000491203 GTF2F2P13984 249 aa7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-210ENST00000491203 ARSBP15848 533 aa7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-210ENST00000491203 USF1P22415 310 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-210ENST00000491203 GABRA2P47869 451 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms