RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490104.5

TSN-208, Transcript of translin, humanhuman

TSL 2

Gene TSN, Length 2,717 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSN-208ENST00000490104 FAM58AQ8N1B3 248 aa11.77□□□□□ -0.52
TSN-208ENST00000490104 MUC15Q8N387 334 aa11.77□□□□□ -0.52
TSN-208ENST00000490104 PXT1Q8NFP0 134 aa11.77□□□□□ -0.52
TSN-208ENST00000490104 MEGF10Q96KG7 1140 aa11.77□□□□□ -0.52
TSN-208ENST00000490104 BEX2Q9BXY8 128 aa11.77□□□□□ -0.52
TSN-208ENST00000490104 PECRQ9BY49 303 aa11.77□□□□□ -0.52
TSN-208ENST00000490104 BEX1Q9HBH7 125 aa11.77□□□□□ -0.52
TSN-208ENST00000490104 NLKQ9UBE8 527 aa11.77□□□□□ -0.52
TSN-208ENST00000490104 HECTD1Q9ULT8 2610 aa11.77□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 CD3DP04234 171 aa11.77□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 GLRA1P23415 457 aa11.77□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 RAB12Q6IQ22 244 aa11.77□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa11.77□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 SETD6Q8TBK2 473 aa11.77□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.77□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 METRNQ9UJH8 293 aa11.77□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 LAMP3Q9UQV4 416 aa11.77□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 GABARAPH6UMI1 98 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 CD80P33681 288 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 NR4A2P43354 598 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 SCAND1P57086 179 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 GPR176Q14439 515 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 FAM76BQ5HYJ3 339 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 CCL17Q92583 94 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 COX4I2Q96KJ9 171 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 AK3Q9UIJ7 227 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 DYSFO75923 2080 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 LYRM1O43325 122 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 SOD3P08294 240 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 LOXP28300 417 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 IL24Q13007 206 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 OR56B4Q8NH76 319 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 CREB3L1Q96BA8 519 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 CMTM3Q96MX0 182 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 OR10A4Q9H209 315 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 GHRLQ9UBU3 117 aa11.76□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 A0A1B0GW55 424 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 RBBP9O75884 186 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 DUX4L2P0CJ85 424 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 DUX4L3P0CJ86 424 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 DUX4L4P0CJ87 422 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 DUX4L5P0CJ88 424 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 DUX4L6P0CJ89 424 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 DUX4L7P0CJ90 424 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 SELLP14151 372 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 FGF12P61328 243 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 MST1LQ2TV78 715 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 PTX4Q96A99 478 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 PPA2Q9H2U2 334 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 GCM1Q9NP62 436 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 DUX4Q9UBX2 424 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 TRAV6A0A075B6T7 132 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 RFPL4AA6NLU0 287 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 C17orf100A8MU93 164 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 MFNGO00587 321 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 HPXP02790 462 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 PGA5P0DJD9 388 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 GIFP27352 417 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 ASCL4Q6XD76 172 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 DECR2Q9NUI1 292 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa11.75□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 MPZP25189 248 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 CDKN1AP38936 164 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 GABRA2P47869 451 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 DEFA1P59665 94 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 DEFA3P59666 94 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 PRR18Q8N4B5 295 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 GCSAMQ8N6F7 178 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 CCDC107Q8WV48 283 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 FBXW5Q969U6 566 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 NRIP2Q9BQI9 281 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 TM2D1Q9BX74 207 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 SAP30LQ9HAJ7 183 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 PALMDQ9NP74 551 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 IFT46Q9NQC8 304 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 NDUFS7O75251 213 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 PMP2P02689 132 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 LPLP06858 475 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 CHRM2P08172 466 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 CHATP28329 748 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 HACD4Q5VWC8 232 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 GPX8Q8TED1 209 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 DNAJB11Q9UBS4 358 aa11.74□□□□□ -0.53
TSN-208ENST00000490104 FBLN5Q9UBX5 448 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms