RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483538.1

POLR1A-207, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-207ENST00000483538 MED30Q96HR3 178 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 CYYR1Q96J86 154 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 HMG20AQ9NP66 347 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 SCN3BQ9NY72 215 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 NUP50Q9UKX7 468 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 COL6A5A8TX70 2615 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 K7N7A8 449 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 GPR37O15354 613 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 HAND1O96004 215 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 ALDOBP05062 364 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 NDUFB7P17568 137 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 PRKACAP17612 351 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 OR3A1P47881 315 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 DLX6P56179 175 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 ARF6P62330 175 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF273Q14593 569 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 MED22Q15528 200 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 DDI2Q5TDH0 399 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 HCP5Q6MZN7 132 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 Q6P435 159 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 MKXQ8IYA7 352 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 Q8NFD4 153 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 KPTNQ9Y664 436 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 A0A1W2PP11 408 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TOX4O94842 621 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 CDRT1O95170 752 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 IFNA2P01563 188 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 CD2P06729 351 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 LIPFP07098 398 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 CCL3L1P16619 93 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 BDKRB2P30411 391 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 HILS1P60008 231 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 ERVFRD-1P60508 538 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 GABARAPL2P60520 117 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 RPS25P62851 125 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 KLRD1Q13241 179 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TPBGQ13641 420 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 SSX1Q16384 188 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 LIPKQ5VXJ0 399 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 ELP2Q6IA86 826 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 PHC2Q8IXK0 858 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 Q8IYB0 196 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 OR8H2Q8N162 312 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 PNKDQ8N490 385 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TEX29Q8N6K0 151 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 PXT1Q8NFP0 134 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TMED9Q9BVK6 235 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 CHST6Q9GZX3 395 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 NOX4Q9NPH5 578 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 ANK2Q01484 3957 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 SIRPB1O00241 398 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TCF21O43680 179 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 OR2H2O95918 312 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 IGHV1-69P01742 117 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 CHRM2P08172 466 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TMEM225BP0DP42 221 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms