RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 hADV38S2A0JD32 116 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 H0YHG0 523 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 M0R129 80 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 PRKYO43930 277 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 MMP23AO75900 390 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 INMTO95050 263 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHA1P01876 353 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 ANXA8P13928 327 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 CCL1P22362 96 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 CD24P25063 80 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
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SMARCE1-210ENST00000481231 CXCR4P61073 352 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 GNGT1P63211 74 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZSR3 168 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.51□□□□□ -1.21
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SMARCE1-210ENST00000481231 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 MYDGFQ969H8 173 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 SLAMF9Q96A28 289 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 NSL1Q96IY1 281 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 SNX22Q96L94 193 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 ADGRL4Q9HBW9 690 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.51□□□□□ -1.21
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SMARCE1-210ENST00000481231 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 SNX5Q9Y5X3 404 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 AQP12BA6NM10 295 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 H3BSH0 61 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 HAND1O96004 215 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 T-ENOLP0DO92 83 aa7.5□□□□□ -1.21
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SMARCE1-210ENST00000481231 HTR1DP28221 377 aa7.5□□□□□ -1.21
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SMARCE1-210ENST00000481231 DGCR2P98153 550 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 IL18R1Q13478 541 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2V2Q15819 145 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 GRK1Q15835 563 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 ODF4Q2M2E3 257 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.5□□□□□ -1.21
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SMARCE1-210ENST00000481231 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 AQP12AQ8IXF9 295 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 PRR25Q96S07 402 aa7.5□□□□□ -1.21
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SMARCE1-210ENST00000481231 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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SMARCE1-210ENST00000481231 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 H3BUI4 141 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 SYT7O43581 403 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 PSPNO60542 156 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 RPP14O95059 124 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 CLIC3O95833 236 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 AMY1AP04745 511 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 AMY2AP04746 511 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 LPLP06858 475 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 CALB2P22676 271 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 PEX2P28328 305 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 OR3A1P47881 315 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 FUT6P51993 359 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 P2RX3P56373 397 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 ACTR3P61158 418 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 CBX1P83916 185 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF91Q05481 1191 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 AADACL4Q5VUY2 407 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 FAHD1Q6P587 224 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 SSX6Q7RTT6 188 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.49□□□□□ -1.21
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