RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 MGAT4AQ9UM21 535 aa5.97□□□□□ -1.45
SHQ1-207ENST00000475558 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SHQ1-207ENST00000475558 TRAV18A0A075B6X5 111 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 INAFM1C9JVW0 142 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 RAB27BO00194 218 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 SH2D1BO14796 132 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 CDC14BO60729 498 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 FSTL3O95633 263 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 MPIG6BO95866 241 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 HLA-DQB1P01920 261 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 CD55P08174 381 aa5.96□□□□□ -1.46
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SHQ1-207ENST00000475558 MGMTP16455 207 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 TBPP20226 339 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 FUT3P21217 361 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 CDK2P24941 298 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 RCVRNP35243 200 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 GATA4P43694 442 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 KCNJ3P48549 501 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF81P51508 661 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 GPM6AP51674 278 aa5.96□□□□□ -1.46
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SHQ1-207ENST00000475558 FGF12P61328 243 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 KCNJ8Q15842 424 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 CDNFQ49AH0 187 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 SPIN3Q5JUX0 258 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 AGAP6Q5VW22 663 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 DNM1P46Q6ZS02 220 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 SLC25A26Q70HW3 274 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 C1orf87Q8N0U7 546 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF611Q8N823 705 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 CHST4Q8NCG5 386 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 OR4M1Q8NGD0 313 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 RFT1Q96AA3 541 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 RAB3CQ96E17 227 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 Q96MF0 132 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM204Q9BSN7 226 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 SELENOIQ9C0D9 397 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 CHST6Q9GZX3 395 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 TLNRD1Q9H1K6 362 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 AUNIPQ9H7T9 357 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 DECR2Q9NUI1 292 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 TREM2Q9NZC2 230 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 NPAP1Q9NZP6 1156 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 COPZ2Q9P299 210 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 V9GYH0 126 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 DSCAMO60469 2012 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 A0A1W2PPR1 153 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 FUOMA2VDF0 154 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 SMIM30A4D0T7 59 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 MCRIP1C9JLW8 97 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 H7C417 338 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 M0R233 179 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 NDUFA2O43678 99 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 LPLP06858 475 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 CSF1P09603 554 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 CTXN2P0C2S0 81 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 CCKARP32238 428 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 MPV17P39210 176 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 OR3A4PP47883 348 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 VEGFCP49767 419 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 TAS2R20P59543 309 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 ACTBL2Q562R1 376 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 TOMM5Q8N4H5 51 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 SCCPDHQ8NBX0 429 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 OR2Z1Q8NG97 314 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 SMIM4Q8WVI0 70 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 AQP3Q92482 292 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 ABHD1Q96SE0 405 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 RAB1BQ9H0U4 201 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 LPAR5Q9H1C0 372 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 OR51B6Q9H340 312 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 RAB9BQ9NP90 201 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 MTFP1Q9UDX5 166 aa5.95□□□□□ -1.46
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