RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 OPN4Q9UHM6 478 aa12.88□□□□□ -0.35
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PTPRU-204ENST00000428026 MOGAT1Q96PD6 335 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRU-204ENST00000428026 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRU-204ENST00000428026 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa12.85□□□□□ -0.35
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PTPRU-204ENST00000428026 CTLA4P16410 223 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRU-204ENST00000428026 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
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