RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 OR5M11Q96RB7 305 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 GPER1Q99527 375 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 K7N7A8 449 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 GABRPO00591 440 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 RGS10O43665 173 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 DUSP1P28562 367 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 HILS1P60008 231 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 ACSM1Q08AH1 577 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 PDCD1Q15116 288 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 SPHARQ15513 63 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 MED22Q15528 200 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 LHX4Q969G2 390 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 OR14A2Q96R54 314 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 HMG20AQ9NP66 347 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 C19orf12Q9NSK7 152 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-205ENST00000426683 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 A0A1W2PPK0 400 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 ZNF737O75373 536 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 ALDOBP05062 364 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 BDKRB2P30411 391 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 ZNF146Q15072 292 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.83□□□□□ -0.04
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HERC3-205ENST00000426683 DDI2Q5TDH0 399 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.83□□□□□ -0.04
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HERC3-205ENST00000426683 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 OR4M1Q8NGD0 313 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 JMJD8Q96S16 334 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.83□□□□□ -0.04
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HERC3-205ENST00000426683 CKLFQ9UBR5 152 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 GLS2Q9UI32 602 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.83□□□□□ -0.04
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HERC3-205ENST00000426683 M0R1W7 72 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 BPIFB3P59826 476 aa14.82□□□□□ -0.04
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HERC3-205ENST00000426683 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.82□□□□□ -0.04
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HERC3-205ENST00000426683 PXT1Q8NFP0 134 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 SNX22Q96L94 193 aa14.82□□□□□ -0.04
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HERC3-205ENST00000426683 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.81□□□□□ -0.04
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HERC3-205ENST00000426683 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 GPX5O75715 221 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 IGHV1-69P01742 117 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 FSTP19883 344 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 GABRR1P24046 479 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 TGFBR2P37173 567 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 OR3A4PP47883 348 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 DLX1P56177 255 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 BLMHQ13867 455 aa14.81□□□□□ -0.04
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HERC3-205ENST00000426683 PIN1P1O15428 100 aa14.8□□□□□ -0.04
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HERC3-205ENST00000426683 EDDM3AQ14507 147 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 GRK1Q15835 563 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 GDPD3Q7L5L3 318 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 PHC2Q8IXK0 858 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 MS4A15Q8N5U1 240 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-205ENST00000426683 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.8□□□□□ -0.04
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