RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 TLE4Q04727 773 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 DHRS2Q13268 280 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 GUSBP1Q15486 140 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 MICBQ29980 383 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CHRFAM7AQ494W8 412 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 NHLRC3Q5JS37 347 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR52W1Q6IF63 320 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C11orf88Q6PI97 169 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 Q6ZT83 130 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 MKXQ8IYA7 352 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR51F2Q8NH61 342 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 MITD1Q8WV92 249 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PLK3Q9H4B4 646 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CA10Q9NS85 328 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OPN4Q9UHM6 478 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PRSS50Q9UI38 385 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 GPR132Q9UNW8 380 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 VSIG4Q9Y279 399 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SPG11Q96JI7 2443 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR5B21A6NL26 309 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 POM121CA8CG34 1229 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF850A8MQ14 1090 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 G3V3Q6 166 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 GOSR2O14653 212 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 IFNA7P01567 189 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CD8AP01732 235 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CCNOP22674 350 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CHATP28329 748 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 IL13RA1P78552 427 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C3AR1Q16581 482 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TBC1D28Q2M2D7 210 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TFAP2EQ6VUC0 442 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00596Q86U02 117 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR56B2PQ8NGI1 322 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR6K3Q8NGY3 331 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 LILRB4Q8NHJ6 448 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TAAR6Q96RI8 345 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CHIAQ9BZP6 476 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PPA2Q9H2U2 334 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C12orf49Q9H741 205 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 NCKAP5O14513 1909 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C9orf170A2RU37 121 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 RFPL4AA6NLU0 287 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR2AT4A6NND4 320 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CD300LBA8K4G0 201 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 M0R233 179 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PDCD6O75340 191 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CSN2P05814 226 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 GLAP06280 429 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CRHP06850 196 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CD99P14209 185 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SELEP16581 610 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 FUT3P21217 361 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 GABRR1P24046 479 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 H2BFSP57053 126 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PRDX4Q13162 271 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM211Q6ICI0 200 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM65Q6PI78 240 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TEX261Q6UWH6 196 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 FBXW12Q6X9E4 464 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF573Q86YE8 665 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SLC30A7Q8NEW0 376 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 MRGPRFQ96AM1 343 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF75AQ96N20 296 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TRIB1Q96RU8 372 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.9 ms