RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 COX5BP10606 129 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 ZNF708P17019 499 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 RPS18P62269 152 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 TMEM200AQ86VY9 491 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 OR10AD1Q8NGE0 317 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 FAM173AQ9BQD7 235 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 SULT4A1Q9BR01 284 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 ZNF286AQ9HBT8 521 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 ASCL3Q9NQ33 180 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 PRR13Q9NZ81 148 aa20.58■□□□□ 0.88
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PMS1-205ENST00000409985 CST4P01036 141 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 ZNF728P0DKX0 622 aa20.57■□□□□ 0.88
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PMS1-205ENST00000409985 TMED6Q8WW62 240 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
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PMS1-205ENST00000409985 IGKV1D-12P01611 117 aa20.56■□□□□ 0.88
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PMS1-205ENST00000409985 SCNM1Q9BWG6 230 aa20.56■□□□□ 0.88
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PMS1-205ENST00000409985 BHLHE23Q8NDY6 225 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 ST3GAL6Q9Y274 331 aa20.56■□□□□ 0.88
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PMS1-205ENST00000409985 FUT3P21217 361 aa20.55■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 ID4P47928 161 aa20.55■□□□□ 0.88
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PMS1-205ENST00000409985 TMEM187Q14656 261 aa20.55■□□□□ 0.88
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PMS1-205ENST00000409985 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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PMS1-205ENST00000409985 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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PMS1-205ENST00000409985 ACTL6AO96019 429 aa20.52■□□□□ 0.88
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PMS1-205ENST00000409985 RRADP55042 308 aa20.52■□□□□ 0.88
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