RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409543.6

TSPAN4-209, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,031 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-209ENST00000409543 TGFBR2P37173 567 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4-209ENST00000409543 EDDM3BP56851 147 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4-209ENST00000409543 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4-209ENST00000409543 ZNF146Q15072 292 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4-209ENST00000409543 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4-209ENST00000409543 ZNF555Q8NEP9 628 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4-209ENST00000409543 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4-209ENST00000409543 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4-209ENST00000409543 C16orf95Q9H693 158 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4-209ENST00000409543 NEK6Q9HC98 313 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4-209ENST00000409543 IL36RNQ9UBH0 155 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4-209ENST00000409543 RNF114Q9Y508 228 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN4-209ENST00000409543 TMEM212A6NML5 194 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 E9PI62 339 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 ALX3O95076 343 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 ZFPL1O95159 310 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 CCDC159P0C7I6 412 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 ZNF728P0DKX0 622 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 PEX2P28328 305 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 AANATQ16613 207 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 SPIN3Q5JUX0 258 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 Q6ZSV7 163 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 OR13C9Q8NGT0 318 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 SSX3Q99909 188 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 JAM3Q9BX67 310 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 COMMD4Q9H0A8 199 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 HMG20AQ9NP66 347 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 GLS2Q9UI32 602 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 DSCAML1Q8TD84 2053 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 H3BUX3 64 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 WBP4O75554 376 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 TSPAN9O75954 239 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 PRKACAP17612 351 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 GABRR1P24046 479 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 COX7A1P24310 79 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 DUSP1P28562 367 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 LGALS4P56470 323 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 PROK1P58294 105 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 SERPINA12Q8IW75 414 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 SAXO1Q8IYX7 474 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 PARP16Q8N5Y8 322 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 OR52N4Q8NGI2 321 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 OR5D14Q8NGL3 314 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 OR5AK2Q8NH90 309 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 RFT1Q96AA3 541 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 CITED1Q99966 193 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 RHOFQ9HBH0 211 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 hADV38S2A0JD32 116 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 PSPNO60542 156 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 CLPXO76031 633 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 KDM4BO94953 1096 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 IGKV1D-12P01611 117 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 LIMS3P0CW19 117 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 LIMS4P0CW20 117 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 BMXP51813 675 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 EDDM3AQ14507 147 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 GRK1Q15835 563 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 ZNF714Q96N38 554 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 SPACA5Q96QH8 159 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 SH2D1BO14796 132 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 MGST3O14880 152 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 SULT1B1O43704 296 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 IGHV1-8P0DP01 117 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 CALCBP10092 127 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 ZNF691Q5VV52 312 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 BRICD5Q6PL45 260 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 CRIP3Q6Q6R5 217 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 TCF23Q7RTU1 214 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 RNF144BQ7Z419 303 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 OR4S1Q8NGB4 309 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 OR13D1Q8NGV5 346 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 PPP1R35Q8TAP8 253 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 CHST6Q9GZX3 395 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 PPA2Q9H2U2 334 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 C8orf4Q9NR00 106 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 DHDHQ9UQ10 334 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 LINC00312Q9Y6C7 94 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 LMO1P25800 156 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 DCKP27707 260 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 ERP29P30040 261 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 SNU13P55769 128 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 KRTAP10-3P60369 221 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 TREML4Q6UXN2 200 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 PACRGLQ8N7B6 248 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 OR11H6Q8NGC7 330 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 OR5D18Q8NGL1 313 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TSPAN4-209ENST00000409543 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms