RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 METRNQ9UJH8 293 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 ENSAO43768 121 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 CAV3P56539 151 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 C11orf91Q3C1V1 193 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 CHRFAM7AQ494W8 412 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 BTN2A1Q7KYR7 527 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 C1QL2Q7Z5L3 287 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 NKAIN3Q8N8D7 197 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 TMEM185AQ8NFB2 350 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 HMG20AQ9NP66 347 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 GPR37O15354 613 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 ECDO95905 644 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 AVPP01185 164 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 CALCBP10092 127 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 ADRA2CP18825 462 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 PTGFRP43088 359 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 SNU13P55769 128 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 FABP5Q01469 135 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF146Q15072 292 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 HSD17B12Q53GQ0 312 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 SPIN3Q5JUX0 258 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 BTNL3Q6UXE8 466 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF561Q8N587 486 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 PHYHIPQ92561 330 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 BEX2Q9BXY8 128 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 C7orf69Q9H7B7 122 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 TCF7L1Q9HCS4 588 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 OPN4Q9UHM6 478 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-202ENST00000406506 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 CCRL2O00421 344 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 HAND1O96004 215 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 COL10A1Q03692 680 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 ELP2Q6IA86 826 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 ASCL4Q6XD76 172 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 LYPD6Q86Y78 171 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 JAGN1Q8N5M9 183 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 VCX3AQ9NNX9 186 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 CUBNO60494 3623 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF737O75373 536 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 CDRT1O95170 752 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 NDUFB7P17568 137 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 DUSP1P28562 367 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 MTNR1BP49286 362 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 CAPZA1P52907 286 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 PAX8Q06710 450 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 RSU1Q15404 277 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 NEDD8Q15843 81 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 LRRTM1Q86UE6 522 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 CDH26Q8IXH8 852 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 OR10K1Q8NGX5 313 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 MUL1Q969V5 352 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 DCTN5Q9BTE1 182 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 MRI1Q9BV20 369 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 IL36GQ9NZH8 169 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 AUP1Q9Y679 476 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 MEGF11A6BM72 1044 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 ARL6IP5O75915 188 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 CHRM2P08172 466 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 SRMP19623 302 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 BMXP51813 675 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 FGF12P61328 243 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 C8orf46Q8TAG6 207 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 FAM234AQ9H0X4 552 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 CNTD2Q9H8S5 307 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 SCOCQ9UIL1 159 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 K7N7A8 449 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 TK1P04183 234 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 SRD5A1P18405 259 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 LY6G5BQ8NDX9 201 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 Q8NFD4 153 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 OR4D6Q8NGJ1 314 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 S100A13Q99584 98 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 UQCC2Q9BRT2 126 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 SLITRK2Q9H156 845 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 METTL9Q9H1A3 318 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 GLS2Q9UI32 602 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 ING4Q9UNL4 249 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 TMEM82A0PJX8 343 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 HTR3BO95264 441 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 FSHBP01225 129 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 TFAP2AP05549 437 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-202ENST00000406506 LIPFP07098 398 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms