RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 DLGAP1O14490 977 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 PSPNO60542 156 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 FAM90A15PP0C7V4 464 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 FAM90A13PP0C7W8 464 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 FAM90A14PP0C7W9 464 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 FAM90A24PP0C7X0 464 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 FAM106CPP0CH98 169 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 GABRR1P24046 479 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CDK2P24941 298 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CEACAM3P40198 252 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 KIR2DS1Q14954 304 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 HLA-DRB5Q30154 266 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 STPG2Q8N412 459 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 OR8U1Q8NH10 309 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 SLAMF9Q96A28 289 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CEP19Q96LK0 163 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 SPAG4Q9NPE6 437 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 IL36RNQ9UBH0 155 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJB9Q9UBS3 223 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 LAMP5Q9UJQ1 280 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 PRR32B1ATL7 298 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 HAND1O96004 215 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 TTRP02766 147 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 MNDAP41218 407 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ESRRGP62508 458 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 UTF1Q5T230 341 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35E3Q7Z769 313 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 OR14K1Q8NGZ2 314 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 NSMCE2Q96MF7 247 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 V9GYS6 101 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa15.11■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 TOR1AO14656 332 aa15.11■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 IGHG2P01859 326 aa15.11■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 DUSP1P28562 367 aa15.11■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CD34P28906 385 aa15.11■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 SLX4IPQ5VYV7 408 aa15.11■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 DEGS2Q6QHC5 323 aa15.11■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 HEPN1Q6WQI6 88 aa15.11■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 THNSL2Q86YJ6 484 aa15.11■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ZMAT4Q9H898 229 aa15.11■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 MGST3O14880 152 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 P2RX3P56373 397 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF91Q05481 1191 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 TEX38Q6PEX7 206 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 TEX47Q8TBZ9 253 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CREB3L1Q96BA8 519 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 DGCR6LQ9BY27 220 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 TTTY10Q9BZA0 68 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 U3KQV3 271 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GTI1 187 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 OOSP1A8MZH6 123 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ARPC2O15144 300 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ERP29P30040 261 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 OR3A1P47881 315 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 HES1Q14469 280 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 HNF4GQ14541 408 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 FOXRED2Q8IWF2 684 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 DRAM1Q8N682 238 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 BBS1Q8NFJ9 593 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 OR56B4Q8NH76 319 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 MROQ9BYG7 248 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 PRODHO43272 600 aa15.08■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 FGF16O43320 207 aa15.08■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 CALCBP10092 127 aa15.08■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM11P17152 192 aa15.08■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 PRRX1P54821 245 aa15.08■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa15.08■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 MICAQ29983 383 aa15.08■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 CPOQ8IVL8 374 aa15.08■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 CORO2AQ92828 525 aa15.08■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 EDA2RQ9HAV5 297 aa15.08■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 TAS2R3Q9NYW6 316 aa15.08■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa15.08■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 SLC7A11Q9UPY5 501 aa15.08■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 ALMS1Q8TCU4 4167 aa15.07■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa15.07■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 H3BN98 237 aa15.07■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC22O60826 627 aa15.07■□□□□ 0
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF254O75437 659 aa15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms