RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 GPR137Q96N19 417 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 MS4A10Q96PG2 267 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 SFT2D2O95562 160 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 FMODQ06828 376 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01555Q8NAE3 123 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 RPEQ96AT9 228 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 C8orf44Q96CB5 159 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 A0A096LPE4 126 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PPZ6 126 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
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PTPRM-202ENST00000400053 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB127Q9H1M4 99 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 MSL2Q9HCI7 577 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 H3BMH7 237 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 NEURL1O76050 574 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 PRRX1P54821 245 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM33P57088 247 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 FAM219AQ8IW50 185 aa7.9□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 RAB33BQ9H082 229 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 MMP25Q9NPA2 562 aa7.9□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 GZMMP51124 257 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 DLX1P56177 255 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 M0R1X1 148 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 Q3ZCU0 254 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 TTRP02766 147 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SMIM6P0DI80 62 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 LIMK1P53667 647 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 FDX2Q6P4F2 183 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SFTPA1Q8IWL2 248 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 HELTA6NFD8 242 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 CYR61O00622 381 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 CST2P09228 141 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 IRF3Q14653 427 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 C1RLQ9NZP8 487 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 BRS3P32247 399 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 OR3A1P47881 315 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 PPOXP50336 477 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SCAND1P57086 179 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 DUSP2Q05923 314 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF766Q5HY98 468 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 Q7L0L9 218 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.88□□□□□ -1.15
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