RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM241Q24JQ0 296 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2NLQ5JXB2 153 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 C6orf183Q5T699 404 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF470Q6ECI4 717 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A25Q6KCM7 469 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 HCP5Q6MZN7 132 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF773Q6PK81 442 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLEC18BQ6UXF7 455 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 PID1Q7Z2X4 250 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00596Q86U02 117 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATPAF2Q8N5M1 289 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR52K1Q8NGK4 314 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR8S1Q8NH09 359 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR51Q1Q8NH59 317 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CACNG8Q8WXS5 425 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 FXYD5Q96DB9 178 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 YPEL4Q96NS1 127 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 DSN1Q9H410 356 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRORYQ9H606 182 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACOT13Q9NPJ3 140 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 SDHAF2Q9NX18 166 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 VAPAQ9P0L0 249 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2AT4A6NND4 320 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD300LBA8K4G0 201 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 H3BQ85 93 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 K7EPK0 472 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ENSAO43768 121 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 COX7A2P2O60397 106 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 VAPBO95292 243 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV3-53P01767 116 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAC1P20366 129 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRPS1L1P21108 318 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 IMPA1P29218 277 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCL23P55773 120 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP5J2P56134 94 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAVIN4Q5BKX8 364 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 RESP18Q5W5W9 173 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMN1Q8IY45 258 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPNE9Q8IYJ1 553 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAPTQ8N292 157 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYS1Q8N2H4 156 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDCL2Q8N4E4 241 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 LY6G5BQ8NDX9 201 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2K2Q8NGT1 345 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR6K2Q8NGY2 324 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CMTM2Q8TAZ6 248 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 VAT1Q99536 393 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 TXNIPQ9H3M7 391 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ICOSQ9Y6W8 199 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM131Q92545 1883 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCNX2A6NKB5 2137 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBFOX3A6NFN3 312 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 F5H5P2 479 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 GYG2O15488 501 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYNGR2O43760 224 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRGV3P03979 118 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CECR9P0C854 216 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCGB1C2P0DMR2 95 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 BGNP21810 368 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 RANBP1P43487 201 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 XKP51811 444 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXA1P55317 472 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 DSTNP60981 165 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 STX4Q12846 297 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 BNIP2Q12982 314 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q499Y3 187 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAHD1Q6P587 224 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR59Q6PJI9 974 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPPA2Q7Z7J5 298 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 GALNT10Q86SR1 603 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR6K3Q8NGY3 331 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCGB1C1Q8TD33 95 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDKL2Q92772 493 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 GLT1D1Q96MS3 346 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANAPC13Q9BS18 74 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 COPS4Q9BT78 406 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYT4Q9H2B2 425 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 RHOFQ9HBH0 211 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 STMN3Q9NZ72 180 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC22A14Q9Y267 594 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms