RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.67□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 OR8G5Q8NG78 346 aa14.67□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 TOMM40LQ969M1 308 aa14.67□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 ST8SIA3O43173 380 aa14.67□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 ZNF205O95201 554 aa14.67□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 RAB4AP20338 218 aa14.67□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 H3F3AP84243 136 aa14.67□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 GPR137CQ8N3F9 429 aa14.67□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 OR4X1Q8NH49 305 aa14.67□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 OR1L3Q8NH93 324 aa14.67□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.67□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 PECRQ9BY49 303 aa14.67□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 MMACHCQ9Y4U1 282 aa14.67□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 CLDN34H7C241 214 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 TGOLN2O43493 480 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 DFFBO76075 338 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 DDAH2O95865 285 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 RND2P52198 227 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 CFHR1Q03591 330 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 TMEM187Q14656 261 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 NSDHLQ15738 373 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 ZNF721Q8TF20 911 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 HAS2Q92819 552 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 LMO7DNF2Z398 122 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 AHSA1O95433 338 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 DBHP09172 617 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 FOLR1P15328 257 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 IL11P20809 199 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 OMGP23515 440 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 IL12BP29460 328 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 OR1P1Q8NH06 330 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 BOD1Q96IK1 185 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 CDH20Q9HBT6 801 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.66□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 FAM24AA6NFZ4 105 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 IGHMP01871 453 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 PGA3P0DJD8 388 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 ECI1P42126 302 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 SLC6A8P48029 635 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 C1QL2Q7Z5L3 287 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 TDHQ8IZJ6 230 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 FAM89BQ8N5H3 189 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 OR14L1PQ8NHC6 308 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 LIME1Q9H400 295 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 DKKL1Q9UK85 242 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 B4DEV8 164 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 IGKV3-11P04433 115 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 ANOS1P23352 680 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 ZNF266Q14584 549 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 DNM1P34Q6PK57 102 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 NAA60Q9H7X0 242 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 HSF4Q9ULV5 492 aa14.65□□□□□ -0.06
GDE1-201ENST00000353258 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 DUSP1P28562 367 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 SFTPDP35247 375 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 FAM189A2Q15884 450 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 NPRL2Q8WTW4 380 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 R3HDM4Q96D70 268 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 A0A1B0GU03 582 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 FAM221AA4D161 298 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 OR4A8P0C604 315 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 GP1BBP13224 206 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 RAB11AP62491 216 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 COL10A1Q03692 680 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 SLC35G3Q8N808 338 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 C11orf40Q8WZ69 217 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 SLC7A11Q9UPY5 501 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 FRG2CA6NGY1 282 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 H3BMH7 237 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 M0R143 59 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 NPIPB7O75200 414 aa14.64□□□□□ -0.07
GDE1-201ENST00000353258 CSNK1A1P48729 337 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms