RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 CLDN15P56746 228 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 TAS2R30P59541 319 aa13.64□□□□□ -0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 PLPPR5Q32ZL2 321 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 RHBDD1Q8TEB9 315 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 H7BYZ3 331 aa13.63□□□□□ -0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 SMIM6P0DI80 62 aa13.63□□□□□ -0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 OR2B11Q5JQS5 317 aa13.63□□□□□ -0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 P2RY1P47900 373 aa13.62□□□□□ -0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 WBP1LQ9NX94 342 aa13.62□□□□□ -0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 DOCK9Q9BZ29 2069 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF735P0CB33 412 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PGA3P0DJD8 388 aa13.62□□□□□ -0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 PLAC9Q5JTB6 97 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 DCAF12Q5T6F0 453 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 KCNIP4Q6PIL6 250 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 OR2M3Q8NG83 312 aa13.62□□□□□ -0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 SMIM7Q9BQ49 75 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 C12orf49Q9H741 205 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SIT1Q9Y3P8 196 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PGA4P0DJD7 388 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 DHRS11Q6UWP2 260 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PSENENQ9NZ42 101 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 LINC00271P0C7V0 271 aa13.62□□□□□ -0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 TGFBR3Q03167 851 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 DEDDO75618 318 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PCNTO95613 3336 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SIRPB1O00241 398 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ERVK-16P61578 105 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 HPSE2Q8WWQ2 592 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 MPPED1O15442 326 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SCGB1D1O95968 90 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP13.61□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 FNDC7Q5VTL7 733 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ABCA7Q8IZY2 2146 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 OR2V1Q8NHB1 315 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CLEC1BQ9P126 229 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 NKX2-6A6NCS4 301 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PPYP01298 95 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 GRPP07492 148 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SPINK2P20155 84 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 RAC1P63000 192 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 OR11L1Q8NGX0 322 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 UFSP2Q9NUQ7 469 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CD63P08962 238 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 KCNE4Q8WWG9 221 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 HEATR5AQ86XA9 2040 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 EPOPA6NHQ4 379 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 IGHMP01871 453 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SSX2Q16385 188 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 TBC1D26Q86UD7 250 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SLC35G3Q8N808 338 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 RNF150Q9ULK6 438 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 MPDZO75970 2070 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 DHRS7CA6NNS2 312 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 IGHEP01854 428 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 MBPP02686 304 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 FABP4P15090 132 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF528Q3MIS6 628 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
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