RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 C14orf79Q96F83 325 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 TP53RKQ96S44 253 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CLCC1Q96S66 551 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF716A6NP11 495 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NUDT19A8MXV4 375 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CA11O75493 328 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SLC34A2O95436 690 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 EDN3P14138 238 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CCNOP22674 350 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CLDN15P56746 228 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CARD18P57730 90 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FAM3AP98173 230 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 EXT1Q16394 746 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SHEQ5VZ18 495 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 AAED1Q7RTV5 226 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SKA3Q8IX90 412 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 OR10D3Q8NH80 312 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ISOC2Q96AB3 205 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CLDN23Q96B33 292 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SPSB1Q96BD6 273 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 WDR54Q9H977 334 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 OR6C6A6NF89 314 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF98A6NK75 572 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 COLCA2A8K830 154 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 C9J4A7 227 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CBR3O75828 277 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 JTBO76095 146 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 TSPAN15O95858 294 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CST2P09228 141 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CBR1P16152 277 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FOLR3P41439 243 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PEA15Q15121 130 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PPA1Q15181 289 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 IGFBP7Q16270 282 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 AVPI1Q5T686 147 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SLC35G3Q8N808 338 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 M1APQ8TC57 530 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 C18orf12Q96KH6 178 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 C12orf57Q99622 126 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FOXB1Q99853 325 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 C12orf49Q9H741 205 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PARP11Q9NR21 331 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 DEPPQ9NTK1 212 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 DECR2Q9NUI1 292 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 EDARQ9UNE0 448 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 A0A096LPE4 126 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PPZ6 126 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 A6NLC8 198 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 E5RGE8 158 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 H7C1Q1 480 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 APOC1P02654 83 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 OMGP23515 440 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 DTYMKP23919 212 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 DUSP1P28562 367 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ECI1P42126 302 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CAMLGP49069 296 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RAC3P60763 192 aa6.28□□□□□ -1.4
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