RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327367.8

SMAD3-201, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD3, Length 6,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-201ENST00000327367 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.65□□□□□ -0.06
SMAD3-201ENST00000327367 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa14.65□□□□□ -0.06
SMAD3-201ENST00000327367 MGPP08493 103 aa14.65□□□□□ -0.06
SMAD3-201ENST00000327367 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.65□□□□□ -0.06
SMAD3-201ENST00000327367 RNF186Q9NXI6 227 aa14.65□□□□□ -0.06
SMAD3-201ENST00000327367 A0A087WUJ7 227 aa14.65□□□□□ -0.06
SMAD3-201ENST00000327367 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa14.65□□□□□ -0.06
SMAD3-201ENST00000327367 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.65□□□□□ -0.06
SMAD3-201ENST00000327367 CRHP06850 196 aa14.65□□□□□ -0.06
SMAD3-201ENST00000327367 RAG2P55895 527 aa14.65□□□□□ -0.06
SMAD3-201ENST00000327367 DNLZQ5SXM8 178 aa14.65□□□□□ -0.06
SMAD3-201ENST00000327367 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SMAD3-201ENST00000327367 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.65□□□□□ -0.06
SMAD3-201ENST00000327367 VAX2Q9UIW0 290 aa14.65□□□□□ -0.06
SMAD3-201ENST00000327367 FZD2Q14332 565 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 OR10AC1Q8NH08 325 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 RAB24Q969Q5 203 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 PIK3C2AO00443 1686 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 M0R3E3 92 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 ST6GAL1P15907 406 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 ATOH7Q8N100 152 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 MARCH5Q9NX47 278 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 OPN4Q9UHM6 478 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 SIGLEC7Q9Y286 467 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 GOSR1O95249 250 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 FAM157CP0CG43 387 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 NGFP01138 241 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 CXCL12P48061 93 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 LEMD1Q68G75 181 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 C4AP0C0L4 1744 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 C4BP0C0L5 1744 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 P01737 135 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 MMP16P51512 607 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 DDA1Q9BW61 102 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 PECRQ9BY49 303 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 LBX1P52954 281 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 WDR31Q8NA23 367 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 FAM131CQ96AQ9 280 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 ZNF273Q14593 569 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 TTC32Q5I0X7 151 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 OR5M9Q8NGP3 310 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 F11P03951 625 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 HTN1P15515 57 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 P2RY1P47900 373 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 ERVFRD-1P60508 538 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 IL20Q9NYY1 176 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 MT-CO3P00414 261 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 KLK2P20151 261 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 PPICP45877 212 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 CEACAM16Q2WEN9 425 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 PDPNQ86YL7 162 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 NAT6Q93015 286 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 IFITM3Q01628 133 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 EXT1Q16394 746 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 DHHO43323 396 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 APELAP0DMC3 54 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 DLX1P56177 255 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 IL10RAQ13651 578 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 OR51M1Q9H341 326 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 OR2T8A6NH00 312 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 TARM1B6A8C7 271 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 IGHEP01854 428 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 NEU3Q9UQ49 428 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 SOCS1O15524 211 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 DNPH1O43598 174 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 FABP2P12104 132 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 HERVK_113P61574 105 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 ZNF79Q15937 498 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 WNT5AP41221 380 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD3-201ENST00000327367 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms