RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 CST2P09228 141 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PIGYQ3MUY2 71 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 C10orf35Q96D05 121 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 IL15RAQ13261 267 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PEA15Q15121 130 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SLC30A7Q8NEW0 376 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FOXB1Q99853 325 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 GGACTQ9BVM4 153 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TREM2Q9NZC2 230 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 OR6C6A6NF89 314 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FGF16O43320 207 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 AKR1C3P42330 323 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF92Q03936 586 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SKA3Q8IX90 412 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ADGRG7Q96K78 797 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 WNT5BQ9H1J7 359 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.2□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CXorf65A6NEN9 183 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 IFNA2P01563 188 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 COX5BP10606 129 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SPINK14Q6IE38 97 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CT55Q8WUE5 264 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 KCNE4Q8WWG9 221 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SPSB1Q96BD6 273 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PIGMQ9H3S5 423 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ACTL6AO96019 429 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 NRASP01111 189 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 OR5H8P0DN80 308 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 LYL1P12980 280 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 GDF1P27539 372 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TAS2R60P59551 318 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TGIF1Q15583 401 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FAM76BQ5HYJ3 339 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 DCAF12Q5T6F0 453 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 DPPA2Q7Z7J5 298 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 OR2V1Q8NHB1 315 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 BORCS8Q96FH0 119 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 OR2H1Q9GZK4 316 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 DOCK7Q96N67 2140 aa14.19□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJC13O75165 2243 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 DNPH1O43598 174 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 GLI4P10075 376 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 RBP2P50120 134 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SP6Q3SY56 376 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TOMM40LQ969M1 308 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 C14orf79Q96F83 325 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TREM1Q9NP99 234 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FAM157CP0CG43 387 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SPCS3P61009 180 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FAM3AP98173 230 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SPEM2Q0P670 501 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 GPR35Q9HC97 309 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 KNTC1P50748 2209 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF407Q9C0G0 2248 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.18□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FRYQ5TBA9 3013 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 COLCA2A8K830 154 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CA11O75493 328 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 RAB2AP61019 212 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ARL6IP1Q15041 203 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 OR2A2Q6IF42 318 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ETV3LQ6ZN32 361 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PSMF1Q92530 271 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PIGCQ92535 297 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 GUCD1Q96NT3 240 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 AQP10Q96PS8 301 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM100Q9NV29 134 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CD79AP11912 226 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SRYQ05066 204 aa14.17□□□□□ -0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms